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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS软件对水分子氢键数目的模拟用哪个模块
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wwwxhr

新虫 (初入文坛)

[求助] MS软件对水分子氢键数目的模拟用哪个模块

我想问一下三个问题
一，MS软件对水分子氢键数目的模拟用哪个模块；
二，模拟时候对水分子数目有限制吗，容器比较大，所以水分子数目的数量级会很大；
三，对水分子结构进行优化排列时候，软件有没有考虑水分子团簇问题。
我刚接触这个软件，边上没人会用这个软件的，所以来求助一下大家
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1楼 2013-11-04 20:26:52
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
一，如果只是计算氢键，在MS build-->Hydrogen Bonds即可计算氢键。
二，模型的大小与计算方法、计算机的性能有关，一般性能的计算机，就计算方法而言，量子力学处理百个级别的原子几乎到极限了；就分子动力学而言，万个级别的原子，也到极限了；
三，软件没有这么智能，团簇模型之类的，需要自己建立模型，如果有这方面的文献，建立模型还是很快的。
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MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
2楼2013-11-04 22:13:11
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wangjing1083

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 月只蓝 at 2013-11-04 22:13:11
一，如果只是计算氢键，在MS build-->Hydrogen Bonds即可计算氢键。
二，模型的大小与计算方法、计算机的性能有关，一般性能的计算机，就计算方法而言，量子力学处理百个级别的原子几乎到极限了；就分子动力学而 ...

请问一下，MS怎么画出氢键结构呢？
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3楼2015-01-13 18:28:11
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