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dolphin_star

木虫 (小有名气)

[求助] 求助 MS中discover模块中建模的问题

想用MS软件中的discover模块,模拟两个较大的分子之间的作用能,应该怎么做呢?是不是把两个分子画在一个xsd的文件中?
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

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★ ★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-12-14 08:15:09
dolphin_star: 金币+1, 有帮助 2012-12-14 09:06:15
引用回帖:
3楼: Originally posted by dolphin_star at 2012-12-13 15:17:01
但是怎么确定分子之间的距离呢?是用那个原子之间的测距吗?我一开始是这么弄的,但是距离改变的是有限的...

分子的距离当然就是各个原子间距的综合。 距离是可以无限改变的。 直接用鼠标拖拽就行了。 你需要熟悉具体操作
4楼2012-12-13 15:32:31
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


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dolphin_star: 金币+1, 有帮助 2012-12-13 15:17:07
是, 可以调整两个分子的距离来计算相互的作用能。
2楼2012-12-13 13:25:46
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dolphin_star

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ddll_slsl at 2012-12-13 13:25:46
是, 可以调整两个分子的距离来计算相互的作用能。

但是怎么确定分子之间的距离呢?是用那个原子之间的测距吗?我一开始是这么弄的,但是距离改变的是有限的
3楼2012-12-13 15:17:01
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fyz_ok

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
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chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-12-14 08:15:23
dolphin_star: 金币+1, 有帮助 2012-12-14 09:06:48
因为你的两个较大的分子,建议你用AC模块把他们建到一个盒子中,再研究
5楼2012-12-13 17:46:37
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沁园春·雪

铁虫 (初入文坛)

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★ ★
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chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-12-14 08:15:30
dolphin_star: 金币+1, 有帮助 2012-12-14 09:08:04
把两个分子建到一个盒子里,跑动力学,然后再求相互作用能,很简单的
大雪无痕
6楼2012-12-13 22:21:06
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dolphin_star

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by ddll_slsl at 2012-12-13 15:32:31
分子的距离当然就是各个原子间距的综合。 距离是可以无限改变的。 直接用鼠标拖拽就行了。 你需要熟悉具体操作...

是不是需要选中某个分子在拖动?我就是这样做的,但是一旦画在某个位置,我就拖不动它了,这个是怎么回事呢?我是刚刚接触这个,我们这边也没有人懂。。。
7楼2012-12-14 09:06:04
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dolphin_star

木虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by fyz_ok at 2012-12-13 17:46:37
因为你的两个较大的分子,建议你用AC模块把他们建到一个盒子中,再研究

我看到的文献都是用的discover模块,不知道你说的那个AC模块全称是什么?
8楼2012-12-14 09:07:36
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dolphin_star

木虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 沁园春·雪 at 2012-12-13 22:21:06
把两个分子建到一个盒子里,跑动力学,然后再求相互作用能,很简单的

怎么放到一个盒子里呢?
9楼2012-12-14 09:07:59
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by dolphin_star at 2012-12-14 09:06:04
是不是需要选中某个分子在拖动?我就是这样做的,但是一旦画在某个位置,我就拖不动它了,这个是怎么回事呢?我是刚刚接触这个,我们这边也没有人懂。。。...

你的操作不对。 需要仔细阅读手册,多多实践。 否则无法开展工作。。。
10楼2012-12-14 10:12:02
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