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共享个资源吧Drug Design and Discovery:Methods and Protocols
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chengfs
2013-02-26
2015-09-03 07:58:25
by
zgxjlx
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MS
]
[已完结]
新手求助,需要用autodock做分子模拟、对接,求文件前期准备操作及资源
(7/1690)
木头珊瑚
2014-10-29
2015-09-02 18:15:46
by
蓝洋飘雪
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DS/Syby
]
[已完结]
Autodock对接问题
(5/910)
无言执隐
2015-06-09
2015-09-02 17:48:08
by
蓝洋飘雪
[
Gromacs
]
关于gromacs的生成文件,cpt等的作用
(0/1241)
吉米爱多
2015-09-02
2015-09-02 17:28:37
by
吉米爱多
[
MS
]
[已完结]
Material Studio 可以构建矿物质与有机质结合的结构模型吗?
(0/571)
DDPS
2015-09-01
2015-09-01 21:16:05
by
DDPS
[
其他
]
[已完结]
化工的分子模拟,有了解的前辈吗?求助
(
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2
)
(19/1080)
龙梅子蓝雨
2015-08-31
2015-09-01 15:22:17
by
wzm9525
[
Gromacs
]
[已完结]
如何在linux系统下安装VMD?
(0/4102)
syd89522
2015-09-01
2015-09-01 14:01:33
by
syd89522
[
MS
]
[已完结]
[关贴]
请问各位大侠,如何查有机物烷基碳链的横截面积啊!
(0/485)
yj112358
2015-09-01
2015-09-01 13:08:13
by
yj112358
[
其他
]
[已完结]
请问怎样可以把得到的轨迹中的每一帧结构做成动画视频
(0/798)
白玉浴血
2015-09-01
2015-09-01 10:34:03
by
白玉浴血
[
Gromacs
]
[已完结]
关于NAMD初学者有几个问题求解答?
(7/2384)
学员qhVMrx
2012-06-11
2015-09-01 07:05:25
by
素君~~~
[
LAMMPS/
]
[已完结]
data文件获取的问题
(2/825)
809011916
2015-08-30
2015-09-01 04:24:57
by
809011916
[
MS
]
[已完结]
discover做能量最小化的时候总是计算失败(如图1)
(7/1528)
zhl1987091
2013-03-18
2015-08-31 19:48:32
by
onionloven
[
MS
]
[已完结]
关于在MS中怎么求平衡态下的统计学量
(2/844)
303103263
2015-08-28
2015-08-31 19:40:20
by
303103263
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其他
]
[已完结]
[关贴]
一氧化氮动力学直径
(0/520)
2009010884
2015-08-31
2015-08-31 17:26:28
by
2009010884
[
资源
]
[已完结]
中科院大连化物所庄魏的毕业论文,最好是他学生的毕业论文
(6/1394)
小小刘亚男
2015-04-13
2015-08-31 14:00:54
by
小小刘亚男
[
LAMMPS/
]
[已完结]
[关贴]
lanmps 安装完成后运行总是报错
(2/424)
胜利笑哈哈
2015-08-26
2015-08-31 12:13:30
by
胜利笑哈哈
[
Gromacs
]
[已完结]
使用VMD中Metagui插件处理数据时出现问题
(0/592)
菲同寻常
2015-08-30
2015-08-30 15:25:47
by
菲同寻常
[
LAMMPS/
]
关于如何用其他软件(matlb,fortran,c#)建立lammps模型的问题
(2/1227)
wddn1206
2014-10-08
2015-08-30 00:41:49
by
alundilong
[
DS/Syby
]
[已完结]
autogrid运行时,出现问题。
(6/1390)
pengxin8086
2013-04-05
2015-08-29 13:11:23
by
awenqiang
[
Gromacs
]
[已完结]
MD分子模拟求界面张力公式,或者知道下面公式的的来源
(评阅+1)
(1/549)
玖月之殇
2015-08-28
2015-08-29 13:07:02
by
luzihen
[
Gromacs
]
[已完结]
硒蛋白M (SELM)
(2/432)
916756502
2015-08-25
2015-08-29 10:24:16
by
916756502
[
LAMMPS/
]
[已完结]
用lammps做CH4的MSD均方位移过程中出现问题
(5/2610)
missingwudi
2015-08-24
2015-08-29 07:32:56
by
lsloneil
[
LAMMPS/
]
[已完结]
求指导?
(4/436)
453695608
2015-08-27
2015-08-28 22:28:52
by
alundilong
[
LAMMPS/
]
[已完结]
lammps计算msd的结果如何输出?
(评阅+1)
(2/6825)
雪雨星风17
2014-01-17
2015-08-28 21:49:00
by
zs806750658
[
Monte C
]
[已完结]
关于MD 模拟中的质量无量纲问题
(4/610)
chuntao118
2015-08-27
2015-08-28 21:04:27
by
wzm9525
[
MS
]
[已完结]
MS建立具有一定粗糙度孔径的介孔分子筛
(5/1619)
shontao
2011-10-31
2015-08-28 17:42:58
by
peerlesszjh
[
MS
]
[已完结]
麻烦算下polycarbonate分子的电子轨道能级
(0/258)
sancareer
2015-08-28
2015-08-28 17:05:05
by
sancareer
[
其他
]
[已完结]
求助画3D英文摘要图
(1/655)
hefchina
2015-06-17
2015-08-28 12:04:02
by
明天的后天90
[
Gromacs
]
[已完结]
求帮处理配体,做蛋白配体复合物分析
(2/751)
frong
2015-08-27
2015-08-28 10:21:00
by
870277182
[
MS
]
[已完结]
有关原子固定问题
(7/1474)
红尘不到
2015-08-24
2015-08-28 09:46:35
by
我是我很简单
[
MS
]
[已完结]
MOPAC中的相变或溶解
(0/309)
chong89
2015-08-28
2015-08-28 09:26:03
by
chong89
[
MS
]
[已完结]
请问大侠,用AC建立晶胞时为什么分子总是团聚在一个角上,而不是均匀分散的
(7/1232)
xysxys
2015-08-23
2015-08-28 09:16:08
by
leebrave
[
MS
]
[已完结]
[关贴]
动力学跑出这样的结构,是什么原因啊?
(6/1656)
lkd-syl
2015-08-26
2015-08-27 19:30:38
by
lkd-syl
[
Gromacs
]
[已完结]
求 gromacs 算例
(2/825)
verylazybird
2015-08-26
2015-08-27 14:04:11
by
verylazybird
[
MS
]
[已完结]
求助 根据文献里面SAPO-34的建模
(1/351)
chaojie718
2015-03-12
2015-08-27 08:22:34
by
feixue222
[
Gromacs
]
【讨论】讨论离子液体gromacs模拟的人太少了!!!
(
1
2
)
(13/2328)
孟广昊
2011-04-11
2015-08-27 07:52:23
by
japmail
[
其他
]
VMD怎么显示模拟盒子的边界?
(6/4973)
badercao
2012-05-15
2015-08-27 05:40:21
by
badercao
[
DS/Syby
]
[已完结]
急!!SYBYL(2.0)怎么查看对接后的配体与原始配体之间的RMSD值?
(评阅+1)
(2/1211)
mei_er
2014-05-17
2015-08-26 21:23:09
by
prometheus7
[
DS/Syby
]
使用sybyl-X总是提示选中分子,请问如何才能选中?
(1/830)
HC山高人为峰
2015-03-12
2015-08-26 21:17:57
by
prometheus7
[
Gromacs
]
amber跑出结果的结合自由能为正值,怎么破?
(
1
2
)
(11/1727)
高桥FC
2015-08-26
2015-08-26 20:47:20
by
百步穿杨999
[
LAMMPS/
]
fix nvt的参数
(2/915)
windsor2010
2015-08-25
2015-08-26 14:42:08
by
Ninazizi
[
其他
]
[已完结]
金属配合物稳定常数分子模拟计算
(评阅+5)
(模拟EPI+1)
(7/3868)
zhaoyunm
2012-02-17
2015-08-26 14:20:07
by
czhcuckooche
[
Gromacs
]
gromacs支持并行有没有最大核数限制?如果拿到超算中心算的话有没有限制?
(3/1321)
吉米爱多
2015-08-25
2015-08-26 08:18:40
by
lsloneil
[
其他
]
[已完结]
有没有什么软件可以显示蛋白的口袋空腔?
(6/1890)
wr1915
2015-06-17
2015-08-26 08:14:47
by
chaoen
[
MS
]
[已完结]
[关贴]
MS的AC模块用packing为什么不能run???
(2/1986)
tsklsakzb
2015-08-25
2015-08-25 16:32:19
by
liu1102yuan
[
Gromacs
]
[已完结]
用GMX做超声,实在不知道如何给局部体积的水分子加一个速度,求大神指点
(1/471)
Terra白骨精
2015-08-25
2015-08-25 16:31:35
by
abinitio
[
LAMMPS/
]
[已完结]
关于粒子冲击的求助
(评阅+6)
(4/1116)
豆总
2014-01-07
2015-08-24 13:37:52
by
tongzhenbo
[
MS
]
[已完结]
求乙酸活化能(化学位)数据
(0/464)
suimin21
2015-08-24
2015-08-24 10:54:19
by
suimin21
[
MS
]
[已完结]
[关贴]
求助!急求助!!急急求助!!!
(0/305)
tsklsakzb
2015-08-24
2015-08-24 10:12:10
by
liu1102yuan
[
MS
]
[已完结]
有机物(乙酸)化学位(活化能)
(0/441)
suimin21
2015-08-24
2015-08-24 10:06:58
by
suimin21
[
Gromacs
]
[已完结]
怎样用VMD软件画出一条MD轨迹中所有构象
(评阅+1)
(3/2329)
fxpy631
2015-08-16
2015-08-24 09:11:58
by
fxpy631
[
Gromacs
]
[已完结]
[关贴]
gromacs能量最小化之后,分子构型都变了!!
(0/1566)
992648352
2015-08-23
2015-08-23 17:03:10
by
992648352
[
MS
]
[已完结]
CASTEP Dynamics NVT 温度波动大
(0/566)
blueShitSir
2015-08-23
2015-08-23 14:50:48
by
blueShitSir
[
LAMMPS/
]
pair_style lj/cut 后面的参数
(2/2266)
windsor2010
2015-08-21
2015-08-23 08:45:03
by
岩土小辈
[
LAMMPS/
]
[已完结]
求助,碳纳米管内套碳纳米管层间距怎么计算?
(2/1027)
hnaymzj
2015-08-22
2015-08-23 01:55:40
by
alundilong
[
Gromacs
]
[已完结]
请问grace安装及.xvg文件作图的问题
(0/2155)
reachsea
2015-08-22
2015-08-22 17:44:30
by
reachsea
[
Gromacs
]
[已完结]
mdrun -c file.pbd
(2/526)
reachsea
2015-08-21
2015-08-22 16:58:58
by
reachsea
[
MS
]
[已完结]
蒙脱石
(8/1952)
只开一次的竹
2013-10-23
2015-08-22 14:07:07
by
用户名华华
[
MS
]
[已完结]
蒙脱石吸附,能量优化
(
1
2
)
(评阅+1)
(18/1581)
jhjh12
2014-11-03
2015-08-22 14:00:39
by
用户名华华
[
MS
]
[已完结]
请教关于ReaxFF的菜鸟级问题
(评阅+1)
(2/1151)
xzzskz
2014-01-07
2015-08-22 07:35:12
by
萌萌的弱弱
[
其他
]
[已完结]
VMD 的TkConsole的Backspace不好用了咋回事呢?
(1/670)
yylcx
2015-08-18
2015-08-21 16:51:00
by
fangsteel
[
资源
]
HCL密度模拟
(0/311)
永卟言弃
2015-08-21
2015-08-21 09:36:59
by
永卟言弃
[
LAMMPS/
]
[已完结]
求助LAMMPS关于MSD计算的问题
(
1
2
)
(17/3624)
胡博洋的洋
2013-05-02
2015-08-20 17:38:54
by
ysu007
[
其他
]
[已完结]
rasmol分子模拟
(0/527)
liyaohui1990
2015-08-20
2015-08-20 14:01:49
by
liyaohui1990
[
DS/Syby
]
【求助】用DS做3D-QSAR药效团
(评阅+1)
(7/1737)
mazhayazi
2010-09-21
2015-08-20 12:20:49
by
cwj420315
[
DS/Syby
]
【求助】DS里药效团验证分析
(6/2118)
木子米米
2010-07-04
2015-08-20 12:02:02
by
cwj420315
[
DS/Syby
]
[已完结]
DS中如何提高药效团的null cost
(4/1013)
童心
2011-04-25
2015-08-20 11:53:50
by
cwj420315
[
Gromacs
]
[已完结]
模拟离子液体时离子对的3d结构能直接从pubchem等数据库下载吗?
(评阅+1)
(9/2761)
amo11000
2014-06-20
2015-08-19 17:46:13
by
japmail
[
DS/Syby
]
[已完结]
做分子对接,有多个同源建模的受体蛋白,该怎么选择?
(评阅+1)
(3/1252)
五月之青青
2015-07-26
2015-08-19 10:19:47
by
东湖渡者
[
其他
]
[已完结]
这种生物蛋白生物膜模型图如何绘制?
(1/770)
zhxq1024
2015-08-12
2015-08-19 10:15:51
by
东湖渡者
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
DS2.5安装后没有3D window
(6/526)
yylcx
2015-08-18
2015-08-18 21:31:03
by
yylcx
[
LAMMPS/
]
[已完结]
【求助】请问有没有人用过lammps中的ZBL势函数的?怎同时用ZBL和另一种势函数?
(4/2067)
tangdu98
2015-08-02
2015-08-18 09:45:01
by
影子政
[
MS
]
[已完结]
MS 如何 建 UO2 和 PuO2 混合物 模型
(0/900)
Anniecubs
2015-08-18
2015-08-18 09:37:54
by
Anniecubs
[
其他
]
我想做一个HCP锆的盒子,请问有做盒子的专门软件吗?
(0/294)
6man
2015-08-17
2015-08-17 21:06:21
by
6man
[
MS
]
[已完结]
MS Discover 动力学求助
(
1
2
)
(10/2712)
yida
2013-04-19
2015-08-16 20:16:50
by
thn1985
[
Gromacs
]
[已完结]
分子动力学模拟中的重现性问题
(评阅+1)
(4/1056)
suibingkuai
2015-08-15
2015-08-16 17:09:25
by
sciencejoy
[
Gromacs
]
[已完结]
NAMD并行计算多少个核合适?
(2/797)
红颜不美
2015-08-14
2015-08-16 05:20:45
by
smutao
[
Gromacs
]
[已完结]
position restrain
(0/511)
zym765319199
2015-08-14
2015-08-14 19:00:00
by
zym765319199
[
DS/Syby
]
[已完结]
请问sybyl模拟的受体除了从PDB获取外,还有哪些网站?
(0/293)
wurenkebi
2015-08-14
2015-08-14 15:38:28
by
wurenkebi
[
MS
]
[已完结]
[关贴]
关于在MS的forcefield力场文件添加新的势函数
(评阅+1)
(0/881)
303103263
2015-08-13
2015-08-13 23:52:49
by
303103263
[
DS/Syby
]
本人新接触这领域,想请问一下有关残基的问题
(评阅+1)
(2/352)
cuenk
2015-08-10
2015-08-13 19:30:26
by
pymol
[
MS
]
[已完结]
DMol3模拟参数设置不懂,总是出错,急呀!
(0/298)
幽幽知心人
2015-08-13
2015-08-13 19:30:07
by
幽幽知心人
[
MS
]
[已完结]
水溶液中的 动力学运行出错,求教!
(评阅+1)
(1/522)
smbluesea
2015-08-12
2015-08-13 13:41:14
by
赵红霞
[
LAMMPS/
]
[已完结]
在in文件要用到几个pair_style的写法
(1/1131)
303103263
2015-08-13
2015-08-13 11:17:22
by
alundilong
[
MS
]
[已完结]
紧急求助!用MS6.1画晶体结构输出的原子表示
(3/734)
ande559
2015-08-12
2015-08-12 22:57:45
by
月只蓝
[
LAMMPS/
]
[已完结]
lammps里Stillinger-Weber 势参数的输入
(4/1589)
303103263
2015-08-10
2015-08-12 15:44:15
by
303103263
[
LAMMPS/
]
lammps安装
(4/784)
学员GMWirO
2015-08-05
2015-08-12 00:52:31
by
alundilong
[
LAMMPS/
]
[已完结]
老师给的程序一直提示Could not find compute stress/atom temperature ID
(2/2106)
vampirherz
2015-08-11
2015-08-11 23:48:24
by
alundilong
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Gromacs
]
[已完结]
关于布朗动力学模拟
(0/1058)
linlin9
2015-08-11
2015-08-11 14:25:25
by
linlin9
[
MS
]
[已完结]
药物晶型模拟
(1/353)
Typh
2015-08-10
2015-08-11 13:28:31
by
pigrass
[
Monte C
]
[已完结]
初学者问Music做Monte Carlo模拟吸附时,写分子文件的几个问题
(5/1179)
youyno
2015-03-13
2015-08-11 07:05:45
by
youyno
[
MS
]
[已完结]
什么是order parameter?
(评阅+1)
(0/719)
xuyihan
2015-08-10
2015-08-10 23:51:43
by
xuyihan
[
LAMMPS/
]
关于lammps中键长的固定的问题
(评阅+1)
(7/2072)
tim562944200
2013-12-19
2015-08-10 21:28:14
by
alundilong
[
MS
]
[已完结]
径向分布函数图问题
(1/877)
Jounry-Jo
2015-08-06
2015-08-10 08:27:56
by
992648352
[
DS/Syby
]
[已完结]
关于MM-PBSA的基本操作
(3/639)
路人甲-ZQY
2015-07-23
2015-08-09 19:01:32
by
micro6790
[
MS
]
discover模块帮助文件中文
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houchaojian
2014-01-19
2015-08-09 14:43:15
by
yqf229118
[
DS/Syby
]
[已完结]
autodock最后一步完成不下去
(1/408)
zhangqian511
2015-07-26
2015-08-08 16:11:57
by
longdlut
[
LAMMPS/
]
[已完结]
氢化石墨烯模型怎么建
(评阅+1)
(6/1799)
31415926535
2014-02-27
2015-08-07 22:19:38
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qcliu
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