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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » discover做能量最小化的时候总是计算失败（如图1）
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zhl1987091

木虫 (小有名气)

[求助] discover做能量最小化的时候总是计算失败（如图1）

我做的是油水界面的模拟，建立完表面活性剂分子后，使用discover做能量最小化的时候总是计算失败（如图1），这个计算不出来构建晶胞的话也提示这样（如图2），求各位大神给予帮助，谢谢了！！！！ 坐等答案！

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追求卓越
1楼 2013-03-18 10:19:36
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yaozhq

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 赞，精辟！ 2013-03-18 15:25:15
你要看详细的错误报告 分析一下是charm没跑起来 还是你的结构不合理造成失败 这么笼统的问 大家比你还迷茫
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2楼2013-03-18 10:32:35
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zhl1987091

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yaozhq at 2013-03-18 10:32:35
你要看详细的错误报告 分析一下是charm没跑起来 还是你的结构不合理造成失败 这么笼统的问 大家比你还迷茫

好的！
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追求卓越
3楼2013-03-18 11:08:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhl1987091

木虫 (小有名气)
File Type                Name
---------                ----

Forcefield                E:\NEWFOL~1\MATERI~1.0X6\share\Discover\res/compass.frc
Molecular data                3D_Atomistic.mdf
Coordinate                3D_Atomistic.car

Error: Energy expression: cannot find parameters for consolidated-torsion: C4(c3a)-O1(o2e)-S1(s3=)-O2(o1=)
Error: Energy expression: cannot find parameters for consolidated-torsion: C4(c3a)-O1(o2e)-S1(s3=)-O3(o1=)
    invoked from within
"minimize \
    method = newton \
    iteration_limit = 5000 \
         sd \
            convergence = 1000.0000000 \
            line_search_precision ..."

Total time used by DISCOVER: 0.17 secs

Completion date: Mon Mar 18 11:11:44 2013
Exiting Discover: An ERROR has occurred!
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追求卓越
4楼2013-03-18 11:13:50
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chaizhm

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhl1987091 at 2013-03-18 11:13:50
File Type                Name
---------                ----

Forcefield                E:\NEWFOL~1\MATERI~1.0X6\share\Discover\res/compass.frc
Molecular data                3D_Atomistic.mdf
Coordinate                3D_Atomistic.car

Error: Energy expression: ca ...

cannot find parameters for consolidated-torsion: C4(c3a)-O1(o2e)-S1(s3=)-O2(o1=)
感觉是力场使用的不对，提示找不到参数
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壁立万仞，无欲则刚
5楼2013-03-18 16:34:55
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赵亚燊

铜虫 (初入文坛)
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 应助指数-1, 没有应助不要点应助回帖 2013-03-18 20:21:20
这个问题，我也遇到了，求指点！那个貌似是什么扭转力矩什么的，在哪里设置啊？
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6楼2013-03-18 18:40:29
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zhl1987091

木虫 (小有名气)
★
chaizhm: 金币+1, 鼓励一下~ 2013-03-19 08:55:10
哈哈，问题终于解决了，竟然把磺酸基的分子式写错了！
有同样问题的，也自己检查一下自己的分子式是不是有问题啊！！
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追求卓越
7楼2013-03-18 19:36:58
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onionloven

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by zhl1987091 at 2013-03-18 19:36:58
哈哈，问题终于解决了，竟然把磺酸基的分子式写错了！
有同样问题的，也自己检查一下自己的分子式是不是有问题啊！！

请问哪里有要写分子式？
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8楼2015-08-31 22:48:32
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