24小时热门版块排行榜    

查看: 1865  |  回复: 7

zhl1987091

木虫 (小有名气)

[求助] discover做能量最小化的时候总是计算失败(如图1)

我做的是油水界面的模拟,建立完表面活性剂分子后,使用discover做能量最小化的时候总是计算失败(如图1),这个计算不出来构建晶胞的话也提示这样(如图2),求各位大神给予帮助,谢谢了!!!! 坐等答案!

1.png



2.png
回复此楼
追求卓越
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yaozhq

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 赞,精辟! 2013-03-18 15:25:15
你要看详细的错误报告 分析一下是charm没跑起来 还是你的结构不合理造成失败 这么笼统的问 大家比你还迷茫
2楼2013-03-18 10:32:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhl1987091

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yaozhq at 2013-03-18 10:32:35
你要看详细的错误报告 分析一下是charm没跑起来 还是你的结构不合理造成失败 这么笼统的问 大家比你还迷茫

好的!
追求卓越
3楼2013-03-18 11:08:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhl1987091

木虫 (小有名气)

File Type                Name
---------                ----

Forcefield                E:\NEWFOL~1\MATERI~1.0X6\share\Discover\res/compass.frc
Molecular data                3D_Atomistic.mdf
Coordinate                3D_Atomistic.car

Error: Energy expression: cannot find parameters for consolidated-torsion: C4(c3a)-O1(o2e)-S1(s3=)-O2(o1=)
Error: Energy expression: cannot find parameters for consolidated-torsion: C4(c3a)-O1(o2e)-S1(s3=)-O3(o1=)
    invoked from within
"minimize \
    method = newton \
    iteration_limit = 5000 \
         sd \
            convergence = 1000.0000000 \
            line_search_precision ..."

Total time used by DISCOVER: 0.17 secs

Completion date: Mon Mar 18 11:11:44 2013
Exiting Discover: An ERROR has occurred!
追求卓越
4楼2013-03-18 11:13:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chaizhm

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhl1987091 at 2013-03-18 11:13:50
File Type                Name
---------                ----

Forcefield                E:\NEWFOL~1\MATERI~1.0X6\share\Discover\res/compass.frc
Molecular data                3D_Atomistic.mdf
Coordinate                3D_Atomistic.car

Error: Energy expression: ca ...

cannot find parameters for consolidated-torsion: C4(c3a)-O1(o2e)-S1(s3=)-O2(o1=)
感觉是力场使用的不对,提示找不到参数
壁立万仞,无欲则刚
5楼2013-03-18 16:34:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

赵亚燊

铜虫 (初入文坛)

感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 应助指数-1, 没有应助不要点应助回帖 2013-03-18 20:21:20
这个问题,我也遇到了,求指点!那个貌似是什么扭转力矩什么的,在哪里设置啊?
6楼2013-03-18 18:40:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhl1987091

木虫 (小有名气)


chaizhm: 金币+1, 鼓励一下~ 2013-03-19 08:55:10
哈哈,问题终于解决了,竟然把磺酸基的分子式写错了!
有同样问题的,也自己检查一下自己的分子式是不是有问题啊!!
追求卓越
7楼2013-03-18 19:36:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

onionloven

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by zhl1987091 at 2013-03-18 19:36:58
哈哈,问题终于解决了,竟然把磺酸基的分子式写错了!
有同样问题的,也自己检查一下自己的分子式是不是有问题啊!!

请问哪里有要写分子式?
8楼2015-08-31 22:48:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhl1987091 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +3 bjdxyxy 2026-08-26 3/150 2026-08-26 12:48 by 小丑鱼爱读书
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +3 yuleib84 2026-08-26 3/150 2026-08-26 12:34 by xiacongxu
[基金申请] 系统查不到 +9 董八千 2026-08-26 9/450 2026-08-26 12:30 by yanmofang
[基金申请] 科研孤儿太难了 +21 我4大白菜 2026-08-20 22/1100 2026-08-26 11:29 by nlgza
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +4 叶九微 2026-08-26 4/200 2026-08-26 10:52 by xiacongxu
[基金申请] 出来了 +8 trojank 2026-08-26 8/400 2026-08-26 09:00 by gxc
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +8 炎黄贵胄 2026-08-22 9/450 2026-08-26 07:47 by WASM
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +3 苏东坡二世 2026-08-23 3/150 2026-08-25 10:35 by shisan1313
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 让我中一个面上吧! +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
请填处理意见