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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » AC建模及Discover能量最小化
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mirror27

木虫 (正式写手)

[求助] AC建模及Discover能量最小化

1、AC建模总是失败，包含有200个气体分子和分子量为二十万的聚合物。
2、氚分子Discover能量最小化不能运行，好像是力场的问题。
请各位大侠不吝赐教，如有相关的资料希望能分享一下哈~
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1楼2012-01-05 22:43:59
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回帖置顶 ( 共有1个 )

量化新手

新虫 (正式写手)
★ ★
chaizhm(金币+2): 2012-01-13 15:45:35
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2012-02-17 22:08:01
mirror27: 回帖置顶 2012-03-22 22:01:28
引用回帖:
2楼: Originally posted by mirror27 at 2012-01-06 10:17:53:
第二个问题换了一个力场可以进行，但为什么compass力场不可以呢？

最好别去搞compass力场，要是已经说了里面没有某个原子的力场参数，你就是添加也没有，加了密的，看不到力场中是怎么样
赞一下(2人) 回复此楼
新手上路，请多关照
3楼2012-01-12 15:40:42
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普通回帖

mirror27

木虫 (正式写手)
第二个问题换了一个力场可以进行，但为什么compass力场不可以呢？
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2楼2012-01-06 10:17:53
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mimizong

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
mirror27(金币+1): ★有帮助 分子小的话可信度就不高了呀！ 2012-02-11 17:53:47
是不是分子量太大了，不清楚
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4楼2012-02-11 10:08:32
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alphawei

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
mirror27: 金币+2, ★有帮助 2012-04-04 09:13:43
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-05 22:52:17
1.可以試試AC先用低密度建模,再用NPT將密度提高!
2.氚的建模是用在哪哩?
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5楼2012-04-03 22:20:20
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mirror27

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by alphawei at 2012-04-03 22:20:20:
1.可以試試AC先用低密度建模,再用NPT將密度提高!
2.氚的建模是用在哪哩?

氚跟氢一样是研究它的扩散的；
AC先用低密度建模,再用NPT將密度提高！——这个要怎么操作呢？菜鸟不太明白
还有就是AC建模的时候不是要根据真实密度来设置吗？
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6楼2012-04-04 09:17:15
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alphawei

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
mirror27: 金币+2 2012-04-05 08:55:37
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-05 22:52:35
AC用低密度建模可以讓聚合物比較好放到盒子中, 比如真�?密度1.0
可以先用0.1的大盒子建模
再用FORCITE的dynamics跑NPT過程因為外界壓力收縮盒子尺寸, 最後平衡可以在接近真�?密度附近!

應該也可以用AC中TASK construction設定more 設定ramp density from......
嘗試看看吧! 希望有幫助!
有聚合物可以分離 H 和T?
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7楼2012-04-04 09:50:09
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mirror27

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by alphawei at 2012-04-04 09:50:09:
AC用低密度建模可以讓聚合物比較好放到盒子中, 比如真�?密度1.0
可以先用0.1的大盒子建模
再用FORCITE的dynamics跑NPT過程因為外界壓力收縮盒子尺寸, 最後平衡可以在接近真�?密度附近!

應該也可以用AC中TASK ...

我也不清楚，纯粹一菜鸟，就是在尝试~
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8楼2012-04-05 08:56:39
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愤怒的姿态

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by alphawei at 2012-04-04 09:50:09
AC用低密度建模可以讓聚合物比較好放到盒子中, 比如真�?密度1.0
可以先用0.1的大盒子建模
再用FORCITE的dynamics跑NPT過程因為外界壓力收縮盒子尺寸, 最後平衡可以在接近真�?密度附近!

應該也可以用AC中TASK c ...

那个，用NPT跑动力学过程，怎么能把密度提高上去呢？请求指导，O(∩_∩)O谢谢！
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9楼2012-11-20 20:30:00
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alphawei

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
zh1987hs: 金币+3, 谢谢 2012-11-23 12:55:00
FORCITE
task選dynamics
按右邊more
方塊中emsemble選NPT
下方壓力設0.1GPa
時間大約用20-50ps應該可以穩定
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10楼2012-11-22 23:46:37
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