应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 【求助】MS建模导入lammps问题求救
151/2返回列表12下一页
查看: 4524  |  回复: 14
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

susie8642

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】MS建模导入lammps问题求救已有8人参与

使用ms建立单晶硅模型后用lammps的msi2lmp生成Si.lammp05文件，其中的masses、pair coeffs、bond coeffs、angle coeffs等都为0，请教原因是什么呢？
还有想问一下，ms生成的对称结构没有办法完全导入lammps嘛？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

Lammps 相关 分子动力学 文书 分子动力学

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼2010-03-23 13:12:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

zyj8119

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+3):谢谢 2010-03-31 09:16
你按照LAMMPS结构，吧MS中文件保存为PDB格式，然后就自己编程了，使用EXCEL的分列格式能够选择PDB文件中需要的列数，然后读入，然后书号格子，确定好格式，输出，FORTRAN做这个功能很好第一次OPEN开INPUT文件，第二次OPEN开LAMMPS的输入文件，就OK了。
赞一下(4人) 回复此楼
好好学习，天天向上。
4楼2010-03-30 22:26:58
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

zyj8119

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-03-25 11:57
也许要编程吧？我看到源代码中，都有转化的源程序。
赞一下(3人) 回复此楼
好好学习，天天向上。
2楼2010-03-25 11:06:18
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qifu

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
高手 回答一下我也需要！
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2010-03-29 11:14:08
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

susie8642

铜虫 (小有名气)

继续请教

引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2010-03-30 22:26:58:
你按照LAMMPS结构，吧MS中文件保存为PDB格式，然后就自己编程了，使用EXCEL的分列格式能够选择PDB文件中需要的列数，然后读入，然后书号格子，确定好格式，输出，FORTRAN做这个功能很好第一次OPEN开INPUT文件，第 ...

感谢3楼。还是有些问题想请教一下，保存为pdb文件后用excel打开发现只有晶格位置信息。那些coeff信息并没有包含。之前是另存为.car文件的，coeff显示为0。这是ms本身的问题嘛？
另外，用fortran读入的内容是直接形成read-data文件嘛？
赞一下 回复此楼
5楼2010-03-31 10:50:33
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-03-31 14:27
这算是问题么？为零的地方，你自己再添上不就妥了吗？只要把原子位置倒过去了，其它的小细节，手动改改不费事，反正你总是要检查一遍的。
赞一下(2人) 回复此楼
6楼2010-03-31 14:18:54
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zyj8119

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-04-08 20:38
MS转到别的软件做法应该也是一样的。。
赞一下(2人) 回复此楼
好好学习，天天向上。
7楼2010-04-08 20:15:24
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ntxsx

新虫 (初入文坛)
受教了
回复此楼
8楼2010-04-09 13:12:49
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zyj8119

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-04-22 20:03
其实其他的软件也可以读入文件的，这个功能几乎所有的语言都有，甚至MATLAB...
赞一下(2人) 回复此楼
好好学习，天天向上。
9楼2010-04-22 19:18:59
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

139564@chen

金虫 (小有名气)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-11-25 18:04:24
我也遇到这个问题，我的错误时因为，在MS中用Dreiding力场保存的*.crd和*.mdf文件，然后强制利用msi2lammps.exe转化成data文件。但是lammps只提供cvff力场的转换，所以生成的data文件的一系列系数都是0了。
赞一下 回复此楼
杂草 就要用杂草的方式去生活
10楼2013-11-25 16:27:06
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 susie8642 的主题更新
151/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复(可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭