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txf8378金虫 (小有名气)
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【求助】Lammps 多机并行的问题 已有7人参与
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前段时间用三台四核机组了个小集群跑lammps，三台机子可以实现无密码互登，运行mpdboot -n 3 mpd.hosts 后可以正常启动三台机器，lammps 编译的也是并行版本，运行 mpirun -np 12 lmp_g++ |
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Loop time of 365.007 on 4 procs for 500000 steps with 8141 atoms Pair time (%) = 212.308 (58.1655) Neigh time (%) = 18.5539 (5.08316) Comm time (%) = 87.2606 (23.9066) Outpt time (%) = 6.84316 (1.8748) Other time (%) = 40.0412 (10.97) Loop time of 471.359 on 8 procs for 500000 steps with 8141 atoms Pair time (%) = 107.436 (22.7928) Neigh time (%) = 10.0425 (2.13055) Comm time (%) = 254.736 (54.0427) Outpt time (%) = 9.67559 (2.0527) Other time (%) = 89.4697 (18.9812) Loop time of 626.302 on 12 procs for 500000 steps with 8141 atoms Pair time (%) = 73.9194 (11.8025) Neigh time (%) = 6.12005 (0.977171) Comm time (%) = 418.673 (66.8484) Outpt time (%) = 9.79431 (1.56383) Other time (%) = 117.795 (18.8081) |
5楼2010-03-25 14:40:38
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-04-13 23:19:24
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http://www.mdbbs.org/thread-19233-1-1.html 会不会是分子模拟论坛上的这种情况呢，不理解服务器并行和单机并行的差别 |
10楼2010-12-11 17:48:58
