24小时热门版块排行榜    

查看: 3767  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

txf8378

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】Lammps 多机并行的问题 已有7人参与

前段时间用三台四核机组了个小集群跑lammps,三台机子可以实现无密码互登,运行mpdboot -n 3 mpd.hosts 后可以正常启动三台机器,lammps 编译的也是并行版本,运行 mpirun -np 12 lmp_g++ xx.out 可以看到三台机子共12核都在运转,可测试发现三台机子并行的计算速度还不如一台机子的速度快,应该是任务分配有问题,但不知道怎么真确分配任务,大侠抬抬手,困扰小弟多时了,泪崩
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

txf8378

金虫 (小有名气)

可是这个通信问题怎么解决啊,还有就是一定要做NFS吗
3楼2010-03-22 09:33:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

老虎大王

木虫 (著名写手)

★ ★
lei0736(金币+2):谢谢 2010-03-19 20:52
这个可能是通讯方面的问题。你看看运行结果(log文件),有个时间使用的报告。
2楼2010-03-19 20:51:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shrek826

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-03-22 12:21
正如沙发所说的,你最好看看log文件最后的时间报告,再决定下一步怎么做
lammps计算一般来说瓶颈不在内存,而在通信
我们这边有人测试过,用10台单机还不如一台有IB高速模块的8核服务器
4楼2010-03-22 12:06:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

txf8378

金虫 (小有名气)

Loop time of 365.007 on 4 procs for 500000 steps with 8141 atoms

Pair  time (%) = 212.308 (58.1655)
Neigh time (%) = 18.5539 (5.08316)
Comm  time (%) = 87.2606 (23.9066)
Outpt time (%) = 6.84316 (1.8748)
Other time (%) = 40.0412 (10.97)




Loop time of 471.359 on 8 procs for 500000 steps with 8141 atoms

Pair  time (%) = 107.436 (22.7928)
Neigh time (%) = 10.0425 (2.13055)
Comm  time (%) = 254.736 (54.0427)
Outpt time (%) = 9.67559 (2.0527)
Other time (%) = 89.4697 (18.9812)


Loop time of 626.302 on 12 procs for 500000 steps with 8141 atoms

Pair  time (%) = 73.9194 (11.8025)
Neigh time (%) = 6.12005 (0.977171)
Comm  time (%) = 418.673 (66.8484)
Outpt time (%) = 9.79431 (1.56383)
Other time (%) = 117.795 (18.8081)
5楼2010-03-25 14:40:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +4 chengyan1220 2026-08-24 6/300 2026-08-26 08:23 by 木水思豆
[基金申请] 牛来!米来!面来! +3 beefly 2026-08-26 3/150 2026-08-26 08:16 by 南海小哥
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +8 炎黄贵胄 2026-08-22 9/450 2026-08-26 07:47 by WASM
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +21 羊腰板 2026-08-21 24/1200 2026-08-26 07:20 by finnigan
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +18 angus9576 2026-08-25 22/1100 2026-08-26 00:41 by merchancy
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 有没有大神帮我看看基金代码 28+4 1234567wang 2026-08-24 10/500 2026-08-25 19:15 by lfy8008
[基金申请] 放榜前的不淡定 20+4 snowwithsea 2026-08-19 19/950 2026-08-25 17:57 by chick875
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +3 苏东坡二世 2026-08-23 3/150 2026-08-25 10:35 by shisan1313
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +25 yaoyewhu2008 2026-08-20 27/1350 2026-08-25 08:01 by Equinoxhua
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤?
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
请填处理意见