应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 【求助】Lammps 多机并行的问题
51/1返回列表
查看: 3792  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

txf8378

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】Lammps 多机并行的问题 已有7人参与

前段时间用三台四核机组了个小集群跑lammps，三台机子可以实现无密码互登，运行mpdboot -n 3 mpd.hosts 后可以正常启动三台机器，lammps 编译的也是并行版本，运行 mpirun -np 12 lmp_g++ xx.out 可以看到三台机子共12核都在运转，可测试发现三台机子并行的计算速度还不如一台机子的速度快，应该是任务分配有问题，但不知道怎么真确分配任务，大侠抬抬手，困扰小弟多时了，泪崩
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-03-18 20:59:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

txf8378

金虫 (小有名气)
Loop time of 365.007 on 4 procs for 500000 steps with 8141 atoms

Pair  time (%) = 212.308 (58.1655)
Neigh time (%) = 18.5539 (5.08316)
Comm  time (%) = 87.2606 (23.9066)
Outpt time (%) = 6.84316 (1.8748)
Other time (%) = 40.0412 (10.97)




Loop time of 471.359 on 8 procs for 500000 steps with 8141 atoms

Pair  time (%) = 107.436 (22.7928)
Neigh time (%) = 10.0425 (2.13055)
Comm  time (%) = 254.736 (54.0427)
Outpt time (%) = 9.67559 (2.0527)
Other time (%) = 89.4697 (18.9812)


Loop time of 626.302 on 12 procs for 500000 steps with 8141 atoms

Pair  time (%) = 73.9194 (11.8025)
Neigh time (%) = 6.12005 (0.977171)
Comm  time (%) = 418.673 (66.8484)
Outpt time (%) = 9.79431 (1.56383)
Other time (%) = 117.795 (18.8081)
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2010-03-25 14:40:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★
lei0736(金币+2):谢谢 2010-03-19 20:52
这个可能是通讯方面的问题。你看看运行结果(log文件），有个时间使用的报告。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-03-19 20:51:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

txf8378

金虫 (小有名气)
可是这个通信问题怎么解决啊，还有就是一定要做NFS吗
赞一下 回复此楼
3楼2010-03-22 09:33:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shrek826

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-03-22 12:21
正如沙发所说的，你最好看看log文件最后的时间报告，再决定下一步怎么做
lammps计算一般来说瓶颈不在内存，而在通信
我们这边有人测试过，用10台单机还不如一台有IB高速模块的8核服务器
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2010-03-22 12:06:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-28 16:41 by winsaint
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +3 德尚中行 2026-08-27 3/150 2026-08-28 15:24 by rongshuxia
[教师之家] 导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！ +8 苏东坡二世 2026-08-23 8/400 2026-08-28 14:41 by lkforward
[基金申请] 基金不中，共勉 +11 eulota 2026-08-26 11/550 2026-08-28 14:22 by 火星超人xi
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +3 bud_bud 2026-08-27 6/300 2026-08-28 11:53 by bud_bud
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 基金未中，这种答复是模板吗？ +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜？ 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 系统查不到 +10 董八千 2026-08-26 10/500 2026-08-26 16:30 by Equinoxhua
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 国合现在查不到了吗？ +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭