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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 【求助】Lammps 多机并行的问题
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txf8378

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】Lammps 多机并行的问题已有7人参与

前段时间用三台四核机组了个小集群跑lammps，三台机子可以实现无密码互登，运行mpdboot -n 3 mpd.hosts 后可以正常启动三台机器，lammps 编译的也是并行版本，运行 mpirun -np 12 lmp_g++ xx.out 可以看到三台机子共12核都在运转，可测试发现三台机子并行的计算速度还不如一台机子的速度快，应该是任务分配有问题，但不知道怎么真确分配任务，大侠抬抬手，困扰小弟多时了，泪崩
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1楼2010-03-18 20:59:44
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hnuzhoulin

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
楼主啊，关于lammps的多级并行，

您有什么文档没？
我老是编译不了，老师出错
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6楼2010-11-09 14:50:04
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★
lei0736(金币+2):谢谢 2010-03-19 20:52
这个可能是通讯方面的问题。你看看运行结果(log文件），有个时间使用的报告。
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2楼2010-03-19 20:51:16
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txf8378

金虫 (小有名气)
可是这个通信问题怎么解决啊，还有就是一定要做NFS吗
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3楼2010-03-22 09:33:41
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shrek826

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-03-22 12:21
正如沙发所说的，你最好看看log文件最后的时间报告，再决定下一步怎么做
lammps计算一般来说瓶颈不在内存，而在通信
我们这边有人测试过，用10台单机还不如一台有IB高速模块的8核服务器
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2010-03-22 12:06:49
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