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txf8378

金虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】Lammps 多机并行的问题已有7人参与

前段时间用三台四核机组了个小集群跑lammps，三台机子可以实现无密码互登，运行mpdboot -n 3 mpd.hosts 后可以正常启动三台机器，lammps 编译的也是并行版本，运行 mpirun -np 12 lmp_g++ xx.out 可以看到三台机子共12核都在运转，可测试发现三台机子并行的计算速度还不如一台机子的速度快，应该是任务分配有问题，但不知道怎么真确分配任务，大侠抬抬手，困扰小弟多时了，泪崩

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1楼2010-03-18 20:59:44

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

xiaowu787

木虫 (正式写手)

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★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+3):谢谢 2010-11-14 18:13:34

引用回帖:

Originally posted by txf8378 at 2010-03-25 14:40:38:
Loop time of 365.007 on 4 procs for 500000 steps with 8141 atoms

Pair time (%) = 212.308 (58.1655)
Neigh time (%) = 18.5539 (5.08316)
Comm time (%) = 87.2606 (23.9066)
Outpt time (%) = 6.84 ...

Comm  time (%) = 87.2606 (23.9066)

Comm  time (%) = 254.736 (54.0427)

Comm  time (%) = 418.673 (66.8484)

这一项就是通信时间（我的理解就是节点，核之间的数据交换），你的这一项线性增加，查查你的交换机。或者跑一个大的体系测试一下，看看结果怎么样？希望对你有帮助