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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 【求助】MS建模导入lammps问题求救
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susie8642

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】MS建模导入lammps问题求救 已有8人参与

使用ms建立单晶硅模型后用lammps的msi2lmp生成Si.lammp05文件，其中的masses、pair coeffs、bond coeffs、angle coeffs等都为0，请教原因是什么呢？
还有想问一下，ms生成的对称结构没有办法完全导入lammps嘛？
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1楼 2010-03-23 13:12:10
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susie8642

铜虫 (小有名气)

继续请教

引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2010-03-30 22:26:58:
你按照LAMMPS结构，吧MS中文件保存为PDB格式，然后就自己编程了，使用EXCEL的分列格式能够选择PDB文件中需要的列数，然后读入，然后书号格子，确定好格式，输出，FORTRAN做这个功能很好第一次OPEN开INPUT文件，第 ...

感谢3楼。还是有些问题想请教一下，保存为pdb文件后用excel打开发现只有晶格位置信息。那些coeff信息并没有包含。之前是另存为.car文件的，coeff显示为0。这是ms本身的问题嘛？
另外，用fortran读入的内容是直接形成read-data文件嘛？
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5楼2010-03-31 10:50:33
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★ ★
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ghcacj(金币+1):谢谢 2010-03-25 11:57
也许要编程吧？我看到源代码中，都有转化的源程序。
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好好学习，天天向上。
2楼2010-03-25 11:06:18
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qifu

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
高手 回答一下我也需要！
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3楼2010-03-29 11:14:08
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+3):谢谢 2010-03-31 09:16
你按照LAMMPS结构，吧MS中文件保存为PDB格式，然后就自己编程了，使用EXCEL的分列格式能够选择PDB文件中需要的列数，然后读入，然后书号格子，确定好格式，输出，FORTRAN做这个功能很好第一次OPEN开INPUT文件，第二次OPEN开LAMMPS的输入文件，就OK了。
赞一下(4人) 回复此楼
好好学习，天天向上。
4楼2010-03-30 22:26:58
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