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tiamolhj

金虫 (小有名气)

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[求助] MS 能量最小化出错，急求帮助

报错原因如下
Forcefield D:\PROGRA~1\Accelrys\MATERI~1.0\etc\Gateway\..\..\share\Discover\res/compass.frc

Molecular data CDMPC_unit__2_.mdf
Coordinate CDMPC_unit__2_.car

Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: C1(c)-O2(o1-)
Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: C4(c)-O4(o1-)
Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: C14(c)-O8(o1-)
Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: C21(c)-O9(o1-)
while executing
"energy print +energies"

Total time used by DISCOVER: 0.37 secs

Completion date: Fri Sep 16 11:04:00 2011
Exiting Discover: An ERROR has occurred

中间的主链，糖环结构是根据文献中键长键角所画，侧链上的3个苯环结构（黄色区域）是需要优化的结构，结果出现上面的错误，请前辈帮助，怎么解决？
下面是我的结构

[ Last edited by tiamolhj on 2011-9-16 at 13:11 ]

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1楼2011-09-16 11:06:09

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theallz

金虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-09-22 13:49:49
tiamolhj(金币+2): 多谢，我试试 2011-09-22 16:58:08

引用回帖:

1楼: Originally posted by tiamolhj at 2011-09-16 11:06:09:
报错原因如下
Forcefield D:\PROGRA~1\Accelrys\MATERI~1.0\etc\Gateway\..\..\share\Discover\res/compass.frc

Molecular data CDMPC_unit__2_.mdf
Coordinate CDMPC_unit__2_.car

Error: Energy exp ...

使用Discover计算是基于力场的，提示信息是说你的初始结构中有不能够被自动指定力场类型的原子。

建议手动对所有原子的力场类型进行指定。