24小时热门版块排行榜    

查看: 2465  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

tiamolhj

金虫 (小有名气)

[求助] MS 能量最小化出错,急求帮助

报错原因如下
Forcefield                D:\PROGRA~1\Accelrys\MATERI~1.0\etc\Gateway\..\..\share\Discover\res/compass.frc

Molecular data                CDMPC_unit__2_.mdf
Coordinate                CDMPC_unit__2_.car

Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: C1(c)-O2(o1-)
Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: C4(c)-O4(o1-)
Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: C14(c)-O8(o1-)
Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: C21(c)-O9(o1-)
    while executing
"energy print +energies"

Total time used by DISCOVER: 0.37 secs

Completion date: Fri Sep 16 11:04:00 2011
Exiting Discover: An ERROR has occurred

中间的主链,糖环结构是根据文献中键长键角所画,侧链上的3个苯环结构(黄色区域)是需要优化的结构,结果出现上面的错误,请前辈帮助,怎么解决?
下面是我的结构




[ Last edited by tiamolhj on 2011-9-16 at 13:11 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tiamolhj

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by theallz at 2011-09-22 13:26:20:
使用Discover计算是基于力场的,提示信息是说你的初始结构中有不能够被自动指定力场类型的原子。

建议手动对所有原子的力场类型进行指定。

我将所有原子的立场都改为pcff立场 但是还是报同样的错误,请问这个是什么原因
3楼2011-09-26 11:13:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

theallz

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-09-22 13:49:49
tiamolhj(金币+2): 多谢,我试试 2011-09-22 16:58:08
引用回帖:
1楼: Originally posted by tiamolhj at 2011-09-16 11:06:09:
报错原因如下
Forcefield                D:\PROGRA~1\Accelrys\MATERI~1.0\etc\Gateway\..\..\share\Discover\res/compass.frc

Molecular data                CDMPC_unit__2_.mdf
Coordinate                CDMPC_unit__2_.car

Error: Energy exp ...

使用Discover计算是基于力场的,提示信息是说你的初始结构中有不能够被自动指定力场类型的原子。

建议手动对所有原子的力场类型进行指定。
2楼2011-09-22 13:26:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tiamolhj

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by theallz at 2011-09-22 13:26:20:
使用Discover计算是基于力场的,提示信息是说你的初始结构中有不能够被自动指定力场类型的原子。

建议手动对所有原子的力场类型进行指定。

请问您是哪个学校或科研机构的,可以考虑下在你们那里做外包吗?
4楼2011-09-26 11:16:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dq20081935

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你在setup模块中non-bound选项卡中设置离子的价态了吗?如果成功告我一声!
5楼2012-05-02 12:16:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 13/650 2026-11-09 06:50 by l48hFd8Nwae2
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 15/750 2026-11-09 06:43 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-09 00:14 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 延安大学回应“副教授留绝笔信”:确已离世,正核实举报内容 +3 yexuqing 2026-11-04 5/250 2026-11-07 13:22 by 苏东坡二世
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +10 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 22/1100 2026-11-06 17:18 by 5sJFDKp2kwuI
[考博] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +6 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 8/400 2026-11-06 16:34 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 11/550 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 11/550 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +7 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 17/850 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +7 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 14/700 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 18/900 2026-11-06 13:36 by BkA9Bi5cMhkD
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 5/250 2026-11-06 09:01 by 2lRNluKrJpwL
[考研] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:11 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 kvewwGtKktqB 2026-11-04 11/550 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 02:04 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 10/500 2026-11-06 01:51 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:42 by qL1cU46YIdK0
信息提示
请填处理意见