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个人总结有关MS的各种问题（第一季）
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目录 一 如何构建水体系，有机溶剂体系 2 问题1：MS的Amorphous cell使用出问题 2 问题2：怎么在MS中建立一个64水的盒子 4 问题3：MS中如何选择体系中的水分子 5 问题4：MS中的castep模块金属表面水分子模型的建立 5 问题5：模拟水溶液中有机物或有机离子在金属表面的吸附问题 6 二：结构优化 6 问题1：MS中forcite模块与discover模块中的结构优化有什么区别？ 6 问题2：在MS中用哪个模块进行优化结构 6 问题3：用分子模拟吸附剂的吸附过程 7 问题4：MS中切面几何优化和原子之间的配位 8 问题5：如何在Dmol3模块中实现定向优化 9 问题6：MS 能量最小化出错 9 二：力场选择 10 三：吸附模拟 10 问题1：MS中sorption模块的MC计算 10 问题2：主族金属氧化物切面做吸附小分子要不要考虑自旋极化? 12 问题3：晶体表面吸附的选择性方向弛豫 13 四：模块使用 13 问题1：CASTEP 输出有几点看不懂 13 问题2：那位高手能够介绍一下MS中CASTEP的势能模型的适用范围？（分子模拟论坛） 14 问题3：CASTEP能算pdos的自旋情况吗 15 问题4：在用CASTEP计算材料空位缺陷时，如何才能实现只取一个空位 15 问题5：在CASTEP计算中，k point设置不同，对计算结果有什么影响？ 15 问题6：CASTEP中几何优化问题 16 问题7：MS castep的几个empty band问题 16 问题8：如何在CASTEP中实现电荷密度图示 20 问题9：能带计算（系列） 20 问题10：Dmol3计算动力学无法收敛 22 问题11：如何在Discover计算中分别对相同环境原子分配不同力场类型 23 问题12：如何在CASTEP计算中限制某个原子的移动方向 23 问题13：如何使用DMol3进行动力学计算？ 28 问题14：如何在Dmol3中考虑溶剂化效应 30 五：软件安装 31 问题1：安装步骤（windows 版） 31 问题2：license 问题 32 问题3：gataway 问题 32 六：综合 34 问题1：建模 34 问题2：价态 38 问题3：停电处理 39 问题4：求电导 40 问题5：切平面时如何切出矩形平面 40 问题6：如何使用XRD数据快速建立相关的晶体结构 40 |
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