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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 求助LAMMPS关于MSD计算的问题
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hasisjc

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
10楼: Originally posted by 胡博洋的洋 at 2013-05-10 08:34:40
不会吧，我计算出来的比较符合我的预期值，你在细看看看。如果不是compute命令的问题就fix命令的问题，是不是里面的那个有问题~仔细点~...

后来发现问题所在了，在用fix命令输出时，复制了第一个fix 命令，c_ID里面的ID没有改，一直是原先的，所以就都一样了
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11楼2013-05-11 09:48:53
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老虎大王

木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by hasisjc at 2013-05-09 14:21:26
额~~~我试过这样了，不过计算出来的msd都是一样的，请问是怎么回事呢？
除了all之外，我定义了两个group，分别是两个原子类型，设置了3个compute msd命令，但是计算出来的三组值是一样的~~~...

你再看看，1，group是不是弄错了。2, compute使命是否正确使用。3，是不是写输出的命令搞得不对。
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12楼2013-05-11 22:17:46
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hasisjc

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
12楼: Originally posted by 老虎大王 at 2013-05-11 22:17:46
你再看看，1，group是不是弄错了。2, compute使命是否正确使用。3，是不是写输出的命令搞得不对。...

看过了，是fix ave/time输出时c_ID弄错了，直接复制的第一个，没有改相应的ID
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13楼2013-05-12 09:21:09
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胡博洋的洋

金虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by 老虎大王 at 2013-05-11 22:17:46
你再看看，1，group是不是弄错了。2, compute使命是否正确使用。3，是不是写输出的命令搞得不对。...

老虎大王啊，Buckingham势参数真的没有拟合的方式吗，只能靠实验或者查找文献吗？
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不得求之
14楼2013-05-12 17:53:40
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老虎大王

木虫 (著名写手)
引用回帖:
14楼: Originally posted by 胡博洋的洋 at 2013-05-12 17:53:40
老虎大王啊，Buckingham势参数真的没有拟合的方式吗，只能靠实验或者查找文献吗？...

buckingham势是离子间势，用在金属体系里不一定合适。而且也没有你说的这个体系的buckingham势。
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15楼2013-05-13 10:14:16
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胡博洋的洋

金虫 (小有名气)
引用回帖:
15楼: Originally posted by 老虎大王 at 2013-05-13 10:14:16
buckingham势是离子间势，用在金属体系里不一定合适。而且也没有你说的这个体系的buckingham势。...

嗯，谢谢您。我是看别人的文献发现他们用的是Buckingham势，但是没给全，我觉得他们做得确实有问题~谢谢您提醒~
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不得求之
16楼2013-05-13 15:59:18
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jianzhiyong

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by hasisjc at 2013-05-09 14:31:43
不知道楼主解决这个问题了没有，我是计算了不同group原子的msd的，但是发现结果和group all的是一样的...

请问一下楼主，计算的msd应该用哪一个输出来，求大神指教。。。
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17楼2014-12-15 18:55:40
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ysu007

新虫 (小有名气)
这个命令好难调试
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18楼2015-08-20 20:38:54
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