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hasisjc

新虫 (初入文坛)

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10楼: Originally posted by 胡博洋的洋 at 2013-05-10 08:34:40
不会吧,我计算出来的比较符合我的预期值,你在细看看看。如果不是compute命令的问题就fix命令的问题,是不是里面的那个有问题~仔细点~...

后来发现问题所在了,在用fix命令输出时,复制了第一个fix 命令,c_ID里面的ID没有改,一直是原先的,所以就都一样了
11楼2013-05-11 09:48:53
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老虎大王

木虫 (著名写手)

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8楼: Originally posted by hasisjc at 2013-05-09 14:21:26
额~~~我试过这样了,不过计算出来的msd都是一样的,请问是怎么回事呢?
除了all之外,我定义了两个group,分别是两个原子类型,设置了3个compute msd命令,但是计算出来的三组值是一样的~~~...

你再看看,1,group是不是弄错了。2, compute使命是否正确使用。3,是不是写输出的命令搞得不对。
12楼2013-05-11 22:17:46
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hasisjc

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
12楼: Originally posted by 老虎大王 at 2013-05-11 22:17:46
你再看看,1,group是不是弄错了。2, compute使命是否正确使用。3,是不是写输出的命令搞得不对。...

看过了,是fix ave/time输出时c_ID弄错了,直接复制的第一个,没有改相应的ID
13楼2013-05-12 09:21:09
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胡博洋的洋

金虫 (小有名气)

引用回帖:
12楼: Originally posted by 老虎大王 at 2013-05-11 22:17:46
你再看看,1,group是不是弄错了。2, compute使命是否正确使用。3,是不是写输出的命令搞得不对。...

老虎大王啊,Buckingham势参数真的没有拟合的方式吗,只能靠实验或者查找文献吗?
不得求之
14楼2013-05-12 17:53:40
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老虎大王

木虫 (著名写手)

引用回帖:
14楼: Originally posted by 胡博洋的洋 at 2013-05-12 17:53:40
老虎大王啊,Buckingham势参数真的没有拟合的方式吗,只能靠实验或者查找文献吗?...

buckingham势是离子间势,用在金属体系里不一定合适。而且也没有你说的这个体系的buckingham势。
15楼2013-05-13 10:14:16
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胡博洋的洋

金虫 (小有名气)

引用回帖:
15楼: Originally posted by 老虎大王 at 2013-05-13 10:14:16
buckingham势是离子间势,用在金属体系里不一定合适。而且也没有你说的这个体系的buckingham势。...

嗯,谢谢您。我是看别人的文献发现他们用的是Buckingham势,但是没给全,我觉得他们做得确实有问题~谢谢您提醒~
不得求之
16楼2013-05-13 15:59:18
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jianzhiyong

新虫 (初入文坛)

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9楼: Originally posted by hasisjc at 2013-05-09 14:31:43
不知道楼主解决这个问题了没有,我是计算了不同group原子的msd的,但是发现结果和group all的是一样的...

请问一下楼主,计算的msd应该用哪一个输出来,求大神指教。。。
17楼2014-12-15 18:55:40
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ysu007

新虫 (小有名气)

这个命令好难调试
18楼2015-08-20 20:38:54
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