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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 求助LAMMPS关于MSD计算的问题
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胡博洋的洋

金虫 (小有名气)

[求助] 求助LAMMPS关于MSD计算的问题

大家好，我想问下在LAMMPS中如何计算一个体系中的不同原子的MSD呢，我看了有条命令是定义计算group的MSD，是不是我要把那些不同的原子分别定义成不同的group，然后再
compute 1 group-ID msd
compute 2 group-ID msd
。。。。。。。。。。。。
以此类推下去？
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不得求之
1楼 2013-05-02 19:55:07
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hasisjc

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
12楼: Originally posted by 老虎大王 at 2013-05-11 22:17:46
你再看看，1，group是不是弄错了。2, compute使命是否正确使用。3，是不是写输出的命令搞得不对。...

看过了，是fix ave/time输出时c_ID弄错了，直接复制的第一个，没有改相应的ID
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13楼2013-05-12 09:21:09
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2013-05-03 22:40:38
按手册，试一下不就知道了？没必要在这里问。
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2楼2013-05-02 20:17:53
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胡博洋的洋

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ddll_slsl at 2013-05-02 20:17:53
按手册，试一下不就知道了？没必要在这里问。

嗯，谢谢你提醒，我是怕这样计算出来的结果我分析不出来是否会有负面影响。想听听大家的意见和经验~
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不得求之
3楼2013-05-02 22:58:05
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
jiaoyixiong: 金币+1, 赞，精辟 2013-05-03 22:40:48
你的模型， 当然你自己最有数。 别人帮不了你。
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4楼2013-05-03 21:58:33
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