24小时热门版块排行榜    

查看: 694  |  回复: 3

eify

新虫 (初入文坛)

[交流] AMBER最后轨迹问题请教~~ 已有3人参与

大家好,我跑了一个受体配体复合物,首先跑了10ns,用cpptraj作rmsd后发现不稳定,故而以其rst为crd又跑了10ns,但是跑完后该如何将前后共20ns的轨迹合并得到一条完整的rmsd呢请大家指教
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lccbat

金虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
在cpptraj的输入文件里面把两个轨迹文件都列出来,就可以了
2楼2015-07-30 03:17:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

smutao

禁虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖内容被屏蔽

3楼2015-07-31 22:51:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dingmei

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
cat rms.in
#trajin md.mdcrd
trajin prod1.crd
trajin prod2.crd
trajin prod3.crd
trajin prod4.crd
trajin prod5.crd
trajin prod6.crd
trajin prod7.crd
trajin prod8.crd
trajin prod9.crd
trajin prod10.crd
..................
trajin到一起应该可以的,您参考。
4楼2015-09-07 08:53:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 eify 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见