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longwei1221

铁虫 (小有名气)


[交流] MS程序的forcite模块中不同约束差别太大是怎么回事?

我在用forcite模块进行水的动力学计算时候,得到了均方位移随时间变化的曲线,分四次分别选择了NVT  NPT  NPH  和NVE,结果差别太大了。有两个数量级的差别。另外我在选择不同温度差别也不同,比如300K时候,NVT和NPT差别不他,基本重合,可是在600K(当然实际情况600K已经挥发了)时候就差别很大了,这个我要计算扩散常数该选择什么系综呀?
      另外我要模拟离子液体熔融的LiF盐,好像几个分子动力学模块就只有forcite模块可以提供universe的力场,其他力场好像都无法进行计算,哪位熟悉情况的,可否推荐我使用哪个模块好点?
     还有如果我要进行分子动力学模拟,在针对液体建模时候,怎么才能更加接近实际情况?类似于amorphous cell模块的输入密度的选项好像没有呀,那我怎么才能保证我建模的原子密度与实际情况接近呀?
唉,问题太多了,急切盼望交流,我发的是交流贴,如果你需要金币,我直接给你就是,只希望大家能多多帮忙呀!
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zhenguozq

金虫 (小有名气)


★
longwei1221(金币+1): 谢谢参与
这方面文盲,过来领金币的!
6楼2012-10-07 09:52:12
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blackdogzmz

木虫 (职业作家)


★
longwei1221(金币+1): 谢谢参与
不会....
7楼2012-10-07 11:07:04
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longwei1221

铁虫 (小有名气)


大家的回复让我非常失望……
8楼2012-10-07 16:05:32
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longwei1221

铁虫 (小有名气)


能不能来一个不是仅仅为了金币,稍微讨论两句也好啊,要金币我大把奉送就是
10楼2012-10-08 17:46:23
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xlblank

新虫 (正式写手)


★
longwei1221(金币+1): 谢谢参与
xlblank回复
12楼2012-10-09 15:07:59
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liangjun44

至尊木虫 (著名写手)


★
longwei1221(金币+1): 谢谢参与
我回答一个,amorphous cell是有输入密度的设定的,density那里就是了,target density和ramp density都可以设
13楼2012-10-09 20:08:43
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longwei1221

铁虫 (小有名气)


引用回帖:
13楼: Originally posted by liangjun44 at 2012-10-09 20:08:43
我回答一个,amorphous cell是有输入密度的设定的,density那里就是了,target density和ramp density都可以设

我用了amorhpous cell,可是只能针对类似于水或者甲烷那样的分子,先建好一个分子模型,然后在AC里面填写密度,可是我要建模的是熔盐液体LiF,它们没有成键,不是分子,因此无法建模,而且即使针对单个锂原子被提示没有对应的力场,该如何是好呀?
14楼2012-10-10 13:04:23
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mutueng

银虫 (小有名气)


★
longwei1221(金币+1): 谢谢参与
楼主一下问的问题很多喔。第一个一般做力学的用NPT,不过之前要保证结构可用。第二个不知楼主版本,不能计算问题不明,答不了,discover可以试试。第三个问题,有得设置,不知你所建何物,可以在amorphous建的盒子里面加不同原子,例如水分子和其它原子分开,确定他们比例就行。是不是楼主版本太低?多多看看帮助文件和相关文献吧~~~
15楼2012-11-12 19:44:57
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wuji11

新虫 (初入文坛)


★
longwei1221(金币+1): 谢谢参与
我做聚合物膜的,对于液体目前不懂
16楼2013-05-06 09:42:21
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X_huang

铁虫 (初入文坛)


★
longwei1221(金币+1): 谢谢参与
实际中是NPT系综,计算中用NVT更方便
18楼2013-05-06 17:02:52
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witnessmiao

木虫 (初入文坛)


★
longwei1221(金币+1): 谢谢参与
建立无定形模型的时候有选择密度这一项,我也在用无定形构建溶剂。
19楼2013-05-09 11:04:47
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c25968

铁杆木虫 (著名写手)


NVT更好
20楼2013-05-10 16:30:45
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xcy315

新虫 (初入文坛)


★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我也正在做  也不会 慢慢来吧
21楼2014-12-08 19:43:00
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★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
MSD曲线需要选区间的,比如NPT、NVT要选择能量基本平稳的段,前期的平衡过程不需要纳入msd曲线
23楼2015-09-06 10:43:32
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简单回复
2012-10-07 00:36   回复  
longwei1221(金币+1): 谢谢参与
wuzezhou3楼
2012-10-07 01:15   回复  
longwei1221(金币+1): 谢谢参与
chenghu4楼
2012-10-07 02:40   回复  
longwei1221(金币+1): 谢谢参与
mercivous5楼
2012-10-07 02:56   回复  
longwei1221(金币+1): 谢谢参与
2012-10-08 14:27   回复  
longwei1221(金币+1): 谢谢参与
2012-10-08 23:06   回复  
longwei1221(金币+1): 谢谢参与
wodenankai17楼
2013-05-06 13:03   回复  
longwei1221(金币+1): 谢谢参与
japmail22楼
2015-09-06 08:41   回复  
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