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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » forcite模块中的opotimize cell 选项问题？
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xiuhui

木虫 (正式写手)

[求助] forcite模块中的opotimize cell 选项问题？

我最近在做分子在金属铁表面的吸附。在我通过MS建好Fe晶体之后，要采用forcite模块优化，不知道优化时需要不需要opotimize cell 。我建模通过MS建的，没有实验值。
有人说，MS中的铁晶胞参数就是实验上来的，不用优化。
也有人说，需要再优化。
到底应该如何呢？
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1楼 2012-04-22 22:48:25
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caijj09

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-04-23 18:36:14
xiuhui: 金币+8, ★★★很有帮助 2012-04-24 09:04:28
一般来说，你可以先优化下。因为虽然那些也是实验测出来的，但往往晶体生长条件不一样，得到的晶体参数会有所不同，在计算前，最好自己先优化下。这个值可以与自己的实验结果比较下，看误差大不大。不大的话即可用于模拟
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自强不息
2楼2012-04-23 16:44:03
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xiuhui

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by caijj09 at 2012-04-23 16:44:03:
一般来说，你可以先优化下。因为虽然那些也是实验测出来的，但往往晶体生长条件不一样，得到的晶体参数会有所不同，在计算前，最好自己先优化下。这个值可以与自己的实验结果比较下，看误差大不大。不大的话即可用 ...

感谢您的解答，再请教下查晶胞参数的实验值的文献的时候应该输入怎样的关键词呢，我试了好多都没有查到。晶胞参数是abc,和角度αβθ吗？我查的文献都只有一个a，或者a和c。
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3楼2012-04-24 09:03:11
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caijj09

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
xiuhui: 金币+2, ★★★★★最佳答案 2012-04-24 09:13:32
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiuhui at 2012-04-24 09:03:11:
感谢您的解答，再请教下查晶胞参数的实验值的文献的时候应该输入怎样的关键词呢，我试了好多都没有查到。晶胞参数是abc,和角度αβθ吗？我查的文献都只有一个a，或者a和c。

这有个专门查晶体结构参数文件的网站：http://www.crystallography.net/search.html
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自强不息
4楼2012-04-24 09:06:01
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caijj09

木虫 (职业作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiuhui at 2012-04-24 09:03:11:
感谢您的解答，再请教下查晶胞参数的实验值的文献的时候应该输入怎样的关键词呢，我试了好多都没有查到。晶胞参数是abc,和角度αβθ吗？我查的文献都只有一个a，或者a和c。

关于晶胞参数，建议在搜索时  输入  化合物的化学式  及 “strucuture"
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自强不息
5楼2012-04-24 09:06:55
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xiuhui

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by caijj09 at 2012-04-24 09:06:01:
这有个专门查晶体结构参数文件的网站：http://www.crystallography.net/search.html

非常感谢您提供的网站
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6楼2012-04-24 09:23:47
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