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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS程序的forcite模块中不同约束差别太大是怎么回事？
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longwei1221

铁虫 (小有名气)

[交流] MS程序的forcite模块中不同约束差别太大是怎么回事？

我在用forcite模块进行水的动力学计算时候，得到了均方位移随时间变化的曲线，分四次分别选择了NVT  NPT  NPH  和NVE，结果差别太大了。有两个数量级的差别。另外我在选择不同温度差别也不同，比如300K时候，NVT和NPT差别不他，基本重合，可是在600K（当然实际情况600K已经挥发了）时候就差别很大了，这个我要计算扩散常数该选择什么系综呀？
      另外我要模拟离子液体熔融的LiF盐，好像几个分子动力学模块就只有forcite模块可以提供universe的力场，其他力场好像都无法进行计算，哪位熟悉情况的，可否推荐我使用哪个模块好点？
     还有如果我要进行分子动力学模拟，在针对液体建模时候，怎么才能更加接近实际情况？类似于amorphous cell模块的输入密度的选项好像没有呀，那我怎么才能保证我建模的原子密度与实际情况接近呀？
唉，问题太多了，急切盼望交流，我发的是交流贴，如果你需要金币，我直接给你就是，只希望大家能多多帮忙呀！
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1楼2012-10-07 00:07:15
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longwei1221

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
13楼: Originally posted by liangjun44 at 2012-10-09 20:08:43
我回答一个，amorphous cell是有输入密度的设定的，density那里就是了，target density和ramp density都可以设

我用了amorhpous cell，可是只能针对类似于水或者甲烷那样的分子，先建好一个分子模型，然后在AC里面填写密度，可是我要建模的是熔盐液体LiF，它们没有成键，不是分子，因此无法建模，而且即使针对单个锂原子被提示没有对应的力场，该如何是好呀？
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14楼2012-10-10 13:04:23
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zhenguozq

金虫 (小有名气)
★
longwei1221(金币+1): 谢谢参与
这方面文盲，过来领金币的！
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6楼2012-10-07 09:52:12
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longwei1221

铁虫 (小有名气)
大家的回复让我非常失望……
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8楼2012-10-07 16:05:32
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longwei1221

铁虫 (小有名气)
能不能来一个不是仅仅为了金币，稍微讨论两句也好啊，要金币我大把奉送就是
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10楼2012-10-08 17:46:23
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