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wr1915

新虫 (小有名气)

[求助] 有没有什么软件可以显示蛋白的口袋空腔? 已有1人参与

如题,只知道Pymol的surface显示的是残基的表面,现在想看一下蛋白的配体口袋所形成的内空腔的三维图,能够知道蛋白内部小分子配体口袋的形状,请问有没有什么软件或网页版能做到?
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xiaoqian_xue

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
wr1915: 金币+300, ★★★很有帮助 2015-07-09 14:09:46
pymol软件软件啊!
2楼2015-07-09 14:09:20
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吕学辰

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xiaoqian_xue at 2015-07-09 14:09:20
pymol软件软件啊!

求指导啊!
3楼2015-08-06 20:05:26
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ruoqiu.xiao

铁虫 (小有名气)

CAVER
这是我用CAVER做的
有没有什么软件可以显示蛋白的口袋空腔?
Picture1.png

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

Today-will-be-history.
4楼2015-08-07 11:53:24
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xwnail2003

禁虫 (著名写手)

本帖内容被屏蔽

5楼2015-08-09 14:48:23
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wr1915

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by ruoqiu.xiao at 2015-08-07 11:53:24
CAVER
这是我用CAVER做的

Picture1.png

好的,谢谢!

[ 发自小木虫客户端 ]
6楼2015-08-09 16:37:36
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chaoen

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by ruoqiu.xiao at 2015-08-07 04:53:24
CAVER
这是我用CAVER做的

Picture1.png

请教一下,安装caver插件,pymol的版本是educational没问题吗?我今天下载了pymol 1.7的,但在安装caver时说没法打开
7楼2015-08-26 11:14:47
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