24小时热门版块排行榜    

查看: 2084  |  回复: 6

wr1915

新虫 (小有名气)

[求助] 有没有什么软件可以显示蛋白的口袋空腔? 已有1人参与

如题,只知道Pymol的surface显示的是残基的表面,现在想看一下蛋白的配体口袋所形成的内空腔的三维图,能够知道蛋白内部小分子配体口袋的形状,请问有没有什么软件或网页版能做到?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoqian_xue

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
wr1915: 金币+300, ★★★很有帮助 2015-07-09 14:09:46
pymol软件软件啊!
2楼2015-07-09 14:09:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

吕学辰

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xiaoqian_xue at 2015-07-09 14:09:20
pymol软件软件啊!

求指导啊!
3楼2015-08-06 20:05:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ruoqiu.xiao

铁虫 (小有名气)

CAVER
这是我用CAVER做的
有没有什么软件可以显示蛋白的口袋空腔?
Picture1.png

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

Today-will-be-history.
4楼2015-08-07 11:53:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xwnail2003

禁虫 (著名写手)

本帖内容被屏蔽

5楼2015-08-09 14:48:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wr1915

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by ruoqiu.xiao at 2015-08-07 11:53:24
CAVER
这是我用CAVER做的

Picture1.png

好的,谢谢!

[ 发自小木虫客户端 ]
6楼2015-08-09 16:37:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chaoen

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by ruoqiu.xiao at 2015-08-07 04:53:24
CAVER
这是我用CAVER做的

Picture1.png

请教一下,安装caver插件,pymol的版本是educational没问题吗?我今天下载了pymol 1.7的,但在安装caver时说没法打开
7楼2015-08-26 11:14:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wr1915 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-29 21:22 by 4qO8zhfjr2AX
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 6/300 2026-08-29 21:22 by 4qO8zhfjr2AX
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 3/150 2026-08-29 18:59 by 4FFAWE8HcgUD
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 4/200 2026-08-29 18:15 by 4FFAWE8HcgUD
[公派出国] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 17:30 by 4FFAWE8HcgUD
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +4 tannykie 2026-08-29 4/200 2026-08-29 17:14 by lmz0216
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 14:13 by jCd0dEvKHShX
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-29 14:03 by jCd0dEvKHShX
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 11:51 by jCd0dEvKHShX
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 11:40 by jCd0dEvKHShX
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +3 349506619 2026-08-28 3/150 2026-08-29 10:49 by 木风9012
[教师之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-29 09:26 by G6APbkg8SA6w
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
请填处理意见