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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 蒙脱石吸附，能量优化
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jhjh12

银虫 (小有名气)

[求助] 蒙脱石吸附，能量优化 已有2人参与

我构建了蒙脱石的结构模型，使用运用Sorption板向蒙脱石的双晶胞结构体系中添加水分子，形成一、二、三层水分子，水分子分层也不是很明显，然后用Discover模块进行能量优化，计算出最低能量构型，出现错误，不知道哪一步错了。一直做不出来来。

蒙脱石吸附，能量优化
二层


蒙脱石吸附，能量优化-1
一层


蒙脱石吸附，能量优化-2
三层


蒙脱石吸附，能量优化-3
能量最小化出现错误.jpg
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1楼 2014-11-03 11:49:29
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呀呀杨会苗

铜虫 (初入文坛)
你好，怎么你的可以把水吸附进去，我用sorption就出错了。。。求助！！！多谢多谢呀。
蒙脱石吸附，能量优化-4
sorption.jpg


蒙脱石吸附，能量优化-5
出错.jpg
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2楼2015-01-09 09:29:01
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芝麻小迪

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
2楼: Originally posted by 呀呀杨会苗 at 2015-01-09 09:29:01
你好，怎么你的可以把水吸附进去，我用sorption就出错了。。。求助！！！多谢多谢呀。

sorption.jpg

出错.jpg
...

你的加水失败应该看一下给出的失败的原因是啥，然后解决
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3楼2015-01-10 09:46:41
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呀呀杨会苗

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 芝麻小迪 at 2015-01-10 09:46:41
你的加水失败应该看一下给出的失败的原因是啥，然后解决...

失败以后，下载的文件里面没有后缀为.out的文件…所以也不知道是怎么回事。多谢！

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4楼2015-01-10 15:08:11
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芝麻小迪

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 呀呀杨会苗 at 2015-01-10 15:08:11
失败以后，下载的文件里面没有后缀为.out的文件…所以也不知道是怎么回事。多谢！
...

嗯，不客气，只能再试试了
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5楼2015-01-10 19:47:51
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zyj8119

木虫 (著名写手)
请问你这个结构是怎么得到的？？？
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好好学习，天天向上。
6楼2015-01-23 16:19:12
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呀呀杨会苗

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by zyj8119 at 2015-01-23 16:19:12
请问你这个结构是怎么得到的？？？

这个是从文献找到蒙脱石的晶格参数，然后建立的晶胞

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7楼2015-01-24 17:32:42
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匿名

用户注销 (小有名气)
本帖仅楼主可见
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8楼2015-03-06 21:54:19
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呀呀杨会苗

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by zyj8119 at 2015-01-23 16:19:12
请问你这个结构是怎么得到的？？？

蒙脱石的结构吗，根据文献里面的晶胞参数…网上也有很多模型

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9楼2015-03-07 18:36:18
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jackup

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 呀呀杨会苗 at 2015-01-09 09:29:01
你好，怎么你的可以把水吸附进去，我用sorption就出错了。。。求助！！！多谢多谢呀。

sorption.jpg

出错.jpg
...

请问你建立晶胞后，怎么确定被取代铝或镁原子的位置呢
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10楼2015-03-09 21:42:23
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