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Schrodinger安装求助

jiemotc
求助,win10安装Schrodinger软件后,打开Maestro提示错误,反复安装好多遍依然这个问题,错误提示见附件。求问大家有没有遇到同样问题的,如何解决。错误提示.JPG
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CSP中的P值是怎么分布的

huang998
请问下各位,CSP中的P值怎么区分,比如不全位错,滑移带,堆垛层错?a-b为不全位错,c-d为滑移带,e-f为堆垛层错。
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滑移带,不全位错,堆垛层错中的原子算缺陷原子吗

huang998
滑移带,不全位错,堆垛层错中的原子算缺陷原子吗
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vmd成键混乱问题

分子模拟新手
不论是跑分子动力学,还是简单的能量优化,结果在vmd中显示都出现价键混乱问题。是由于dump格式问题还是vmd操作不当哪里显示设置没弄好呢?望各位指点一下,图我附在下面,谢谢!
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AutoDock分子对接

黎夜5566
使用AutoDock进行分子对接时,提前准备好的大分子蛋白打不开要怎么处理?
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lammps中某个区域压力的求解

2009云飞扬
各位朋友,我建立了一个立方体,中心挖去原子形成一个球孔,在球孔中填入了另一种原子A,想求解球孔区域A原子所形成的压力是多大,在lammps应该怎么操作计算呢。请知道的朋友帮忙指点指点,应该怎么计算才能得到。先谢谢啦。
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用MS模拟离子吸附用哪一个模块呢

943886740
用MS模拟离子吸附用哪一个模块呢现在毫无头绪请教一下大家
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堆垛层错中可以存在滑移带吗

huang998
堆垛层错中可以存在滑移带吗
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autodock中去水时出现这个是什么意思勒

高飞雄
求助:autodock中去水时出现这个是什么意思勒
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lammps运行 温度无法控制

1325379129
在模拟氧化铁烧结时温度无法控制,in文件如下unitsmetalatom_stylefullread_datafe2o316.datavelocityallcreate3...
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各位大神知道怎么在lammps中加磁场吗?

Myprayert
各位大神知道怎么在lammps中加磁场吗?十分感谢
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弛豫后键的数目增加了

ijianhui
请问这是什么情况?怎么解决呀,万分感激!1546915977(1).png
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lammps并行任务运行有误

leepearson
各位好,我最近在服务器上安装lammps,生成了并行程序,但实际运行中,发现log信息如下:~/lammps/lammps-12Dec18/examples/shear$mpirun-np4lmp_serial<in.shearLAMMPS(12Dec2...
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有没有这样一种分子对接的软件???

药剂小学生
有没有这样的一种软件,可以模拟已经的酶,和自己设计的多肽的反应情况?
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各位大神知道怎么使用MS建无定型晶胞吗?

Myprayert
各位大神知道怎么使用MS建无定型晶胞吗?求指导十分感谢
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MS复制粘贴团簇时出现了问题

Myprayert
各位大神,最近按照文献做了一个模型,先建立一个SIO2团簇,然后建立一个周期性空胞,接着将SIO2团簇复制粘贴到空胞的中心,但是我将SIO2团簇换成了Cu原子团簇以后,却发现粘贴的时候出了问题,球形原子团簇被分成了几部分,分别位于空胞的八个角落里,如下图所示,...
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3D-QSAR药效团

落叶~~
用DS进行3D-QSAR药效团构建时,测试集需要像训练集一样挑选吗?
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想购买一台小服务器,一窍不通,求懂行的大侠推荐一下

xzz1007
虽然从事多年理论计算,但是对于计算机还是不太在行目前主要使用MS毕业之后要自立门户想购买一台小服务器,预算3万,不知道该如何入手??不知有没有大侠,能够结合我的预算,推荐一下配置呀??多谢了!!
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用Ms建二氧化硅的模型

百里屠屠屠苏
用Ms建二氧化硅的模型,lammps运行老是提示atommissing,二氧化硅的模型比较简单,在就是用sio2.quartz,然后用nanocluster建的707020不知道错误在哪里,求指教
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求教分子动力学模拟中使模拟对象升温的合理速率是多少呢?和体系的什么参数有关?

mgqqlwq
分子动力学中由于计算能力和时间步长的限制,应该一般只能在几个皮秒至几十个皮秒甚至更短的时间内使目标体系从室温升高到熔点以下的温度。当然不同的材料熔点有很大区别,比如金属或者石墨烯等材料,大概都在几千K,那么1000K/ps量级的升温速率是否符合实际情况中(比如...
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MS动力学计算后晶胞密度不上升

奚奚xixi
MS建模,初始密度设置为0.2,按理说跑完结构优化、NVT、NPT后,密度应该上升至1.2左右,但我跑完了密度几乎无变化,全程也没报错,请问这是怎么回事呢?
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分子模拟 模型构建

蛤蛤蛤额
求教各位大佬,怎么把图一构建的晶体团簇移到图二的盒子中间?之前看贴说是构建好团簇后把团簇复制到盒子文件中,然后在盒子中间掏个洞把团簇整进去,但是刚复制过来还没移动就变成了图三这个样子,完全不知道咋弄,,,另外如何在盒子里面掏洞也是个问题,分子堆积在盒子里面,手...
分子模拟
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关于建立amorphous cell的密度问题

943886740
看文献就是NPT、NVT来回动力学模拟实现密度的还原。我想请教一下,下面的attherelaxeddensity该如何实现,是直接用前面动力学模拟生成的晶胞进行运算吗?还是有其他的操作呢?AccomplishmentofMDsimulationwithNVTe...
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求naDNAno安装包

吓吓夏夏夏
各位前辈,最近想学习DNA折纸的设计,求naDNAno安装包,我的邮箱'917731534qq.com'。
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用lammps命令建个金刚石空心球

njx
请问各位老师同学。用lammps命令建个金刚石空心球有什么技巧呢。
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LAMMPS dump fix bond/swap 5 0.5 1.3 #seed

小小虫儿_
LAMMPS双桥算法中,Kremer-Grest模型,采用双桥算法。fixbond/swap50.51.3#seed,data文件中,每条链molecule_ID编号从1~N(N为链长)。如何输出每条链的构象?
分子模拟
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分子链不在cell里面

943886740
如图,有一条分子链不在cell,是不是需要继续进行dynamic呢。我已经退火操作,并且高温NPT好几次了。
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非平衡分子动力学

追影qwe
materialstudio可以模拟非平衡分子动力学吗?
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有没有付费提供理论计算的单位或公司啊?

iacwj03
有没有付费提供理论计算的单位或公司啊?本人想计算一个体系,金(111)表面上修饰的两个不同有机分子,想看看这两个分子有没有发生相互作用,如果知道有这样的公司,请提供联系方式,谢谢!
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应力、密度云图是通过什么软件导出来的

yj20141116
用lammps做模拟时,请问下面这种应力、密度云图是通过什么软件导出来的呀?N[SS0YD56%HV3}`A`2%TVON.png
分子模拟
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