大家好,我使用autodock vina进行分子对接,随后使用pymol进行可视化处理,发现两个软件显示的氢键数量有所不同,pymol会多上1-2个氢键,请问这是什么原因呢? 返回小木虫查看更多
两个软件判断氢键的标准不一样,你可以看一下,多出来氢键是否真的存在
你可以统一一下氢键标准就行,如果想弄清楚,可以查看氢键相关文献
在么?有问题想请教你
PyMOL显示的氢键作用不一定对,很可能是假阳性。换个分析相互作用的软件,或者换个对接软件。百度搜一下【蛋白/核酸/多肽-小分子对接 DOCK6】,可以分析八大经典相互作用,比市面上很多软件都准确得多,
楼主,您的问题解决了吗 我的是pymol少氢键
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