请教大家,如何得到键角分布函数及桥氧、非桥氧、自由氧的数量
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本人刚接触分子动力学模拟不久,想请教各位老师,如何能够得到键角分布函数,以及桥氧、非桥氧、自由氧的数量呢,如果涉及到编程脚本,非常希望您能够将脚本发给我,这是我的邮箱442202824qq.com,真的非常感谢您!
分子模拟
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DMOL3计算吸附位
qianyunjiu
使用DMOL3模块计算MOFs中有机配体对二甲苯的吸附,想问一下如何确定的吸附位点,我目前是直接把二甲苯模型copy到有机配体附近,然后进行结构优化,但计算失败。想问一下大佬们是什么原因,或者是不可以这样算。输入文件、输出文件的末尾部分如下:输入文件:#Tas...
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Autodock分子对接问题
linhuikang
大家好,我使用autodockvina进行分子对接,随后使用pymol进行可视化处理,发现两个软件显示的氢键数量有所不同,pymol会多上1-2个氢键,请问这是什么原因呢?
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