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如何得到、处理bader数据

流光飞玉
我总结了一些自己处理bader的经验,希望能对大家有所帮助因为本来是为自己实验室的学弟学妹写的,所以有些地方可能与大家的不太相合,具体情况请自行判断文章内容有很多是来自其它网友的帖子,对此表示万分感谢,为我提供了很大帮助
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VASP计算neb问题求助

花花rainbow
请问VASP用NEB方法计算过渡态能量时,使用dist.pl命令查看初末态结构的距离,距离数值在多少范围内比较适合进一步计算。我的初末态结构优化之后距离在52埃,距离这么大是因为初始结构的问题吗?谢谢大家的回答~
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求问phonopy 计算声子谱中 Primitive axis 设置问题

jiafei2190
各位老师在用phonopy计算声子谱过程中,band.conf需要设置Primitiveaxis,想问一下如何得到Primitiveaxis。谢谢大家,好痛苦,没人教
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关于Bader charge的物理意义

abc153266182
最近刚开始学vasp,其中有一项是关于bader电荷分析。大概知道这个计算的目的是为了算分子里每个原子的电荷,但是不明白算这个的意义是什么,也就是从数据能分析出什么结果。请大神不吝赐教
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ATK构建石墨烯电极

明天先生
atk如何构建石墨烯左右双电极!求一份构建文档,酬劳可以商议。先行谢过!类似于图片中Au(1,1,1)这样的左右电极)9_G7HZ)CY6{[QAI%DO7){S.png
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非第一布里渊区声子振动频率

txf8378
请教大家,图中M(110),根据平移对称性,振动频率应该和(000)点一样的,我用phonopy算出来这两点的频率确实一样,但文献中的确是不一样的,这个是怎么回事?如果想用phonopy算出图中X点(110)的频率,在phonopy中q点应该怎么设置?6_5I...
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层结构,相互作用,需算什么

分子模拟新手
建立了两层的结构,想计算其相互作用关系,除了计算相互作用能,还能用ms计算哪些值,来证明其相互作用?用ms,forcite计算出来的可以analysis哪些?为什么我的很多都是灰色的,望各位指点
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所有苯环都变为单键了,怎么整体修改为双键呢?

PSR-
我用MS导入cif文件后,原子之间没有成键,我自己用bond-caculatebond计算了一下,所以原子都连上了。但是我发现结构中所有苯环都是单键了,难道我要手动去修改...
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MS PDOS分波态密度作图问题

gtf4627369
MS中PDOS图的数据copy到origin里作图,如图copy到origin中的数据里-11到-7这一部分是缺失的,导致结果用origin作出的图与MS里的PDOS图不一样,请问各位大佬这是什么原因?要怎么解决?LCKX]~`D_HXSC(BTG]6%B0....
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openmpi 1.6.5编译求助

oppsfang
make文件出现问题icc和ifort都是2011版本的
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用MS怎么模拟不同溶剂对晶体形貌的影响

183177713968
用MS怎么模拟不同溶剂对晶体形貌的影响,我在help里面找了只有真空下的,没有研究不同溶剂的,在网上也没有找到这方面的教程,请大神帮帮忙,谢谢。
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急求会第一性原理的老师或同学,先站内联系

zjmkuang2008
大家好,现准备发一篇文章,数据都够了,但是需要一个模拟,本人是学材料的,对模拟不懂,现找搞第一性原理的老师或同学希望能合作,先站内联系,谢谢!
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CASTEP计算声子谱出现问题

Kelvin Wang
第一次计算声子谱适合结构优化一起进行的计算完之后分析的时候显示如图,不懂什么原因造成的请求大神指正此外我计算的任务一直是收敛到某一步就卡住,用的是台式机八核捕获.PNG
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租机时和购买服务器哪个更合适?

有何不可琼
马上就要工作了,新的学校没有集群,也没有VASP版权。打算通过跟导师师兄合作,解决版权问题。想请教一下大家,租用机时和购买集群,还有购买工作站,以及考虑用学校计算机学院的机器,这些方案之间的利弊?学校给的科研启动基金是10万。院长不太建议买集群,他应该是嫌贵。...
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第一性原理计算的学习,最大的难点是什么?

shuligaoshou
1)(对于新手)最难的是建模,分子结构交个chembiooffice便可(其他建模软件都不好用),晶体结构交给ICSD、CCDC便可(用现成的库便可,自己建太麻烦);2)之后是计算,交给软件就行了,VASP等可以自己写代码定制;3)计算其实是核心的事情,需要掌...
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Material Studio问题请教

幽鹰至尊
在MS中,得到一个.cell文件之后,如何在MS中精确找到对应于.cell文件中每个坐标对应的原子,因为体系原子数较多,粗略看容易混淆
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murn.f, gk.f, pbnd.f, split_dos和vp小程序急求

jll1997
哪位好心人给我传一份候老师教程里的小程序,如murn.f,gk.f,pbnd.f,split_dos和vp,以及syml.fcc,syml.bcc,syml.sc,syml.hex等,感激不荆'1655812789qq.com'
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castep计算出来的能带图和dos图所显示的信息不一致,这是什么原因呢?

CAB云水禅心
castep算出来,结构的带隙为0.195,而且价带没有越过费米能级,但是从dos上看,费米能级处的态密度为1ev,这是怎么回事呢?展宽的问题?还是其他问题?请指教!谢谢!能带图.png能带图放大.pngdos图.png
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求助单点能计算

也许爱你
建了一个10*10*10单胞,(0.5,0.5,0.5)放置一个Mg原子,计算得得能量是固态单胞能量吗?
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请教一个有关脱锂电压的问题

Y/XT
请问大家是不是计算的理论脱锂电压越大,锂电池的放电电压也就越高,性能就越好?谢谢大家
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为什么在一篇SCI论文中一种晶体内部某一种原子的Mulliken电荷都只有一个值

meiqihua
我计算的MUlliken电荷都是不同原子的不一样,即使是同样的硫或铁原子,但该论文的相同种类原子都只列了一个电荷值,请问该值是如何得到的Z[%8}}RYG8%}MV}VZQSJ7{7.png
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体系f电子是否考虑

幽鹰至尊
vasp计算,几种原子查阅元素周期表价电子都是没有f电子的,结构优化后,OUTCAR中显示的totalcharge里显示某种原子含有约0.2个f电子,这种情况下考虑加u计算,LMAXMIX是设置的4计算(针对d电子)还是设置的6计算(针对f电子)
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MS里如何做自旋态密度图? 有自旋向上和自旋向下的那种?

老南孩
大神们,如题求助。我用Dmol3只能做出总DOS,但我向做知道自旋向上和自旋向下的DOS,对称的那种,
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dmol3,orbital

冇冇
计算了orbital,可为什么无法import?QQ截图20180621200213.png
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forcite shear 具体操作

分子模拟新手
各位老师,朋友,我用MS里的forcite模块想做双层的剪切模拟,shear这个task具体是怎么操作,我不是很明白,看教程也没理解透彻,我想问一下,shear是做剪切的,那么如何控制剪切时,正向的正压力呢?还有剪切的力又怎么设置,用NVE吗?为什么我跑出来的...
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求助,有没有做计算的小哥哥或者小姐姐,跟我合作一下。

袁承宗
本人最近在做CO2还原方向,现在想找一个做计算的大神合作,想计算一下复合材料的电子传输和CO2还原过程的吸附问题。求合作。。。联系方式'1801207872qq.com'15555181978
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Materials studio容易学么?

shuligaoshou
Ms,建模很容易(难点就是判断晶体术语哪个群,以及找到尽量接近真实的晶格尺寸),之后是计算(用各种模块都可以运算,设置经验网上都有)。感觉ms很容易吧。大家觉得呢?
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小虫第一次问,想要直到下面的图是怎么做出来的,求好心人解答

Summitcheese
主要轨道占据态怎么画出来。微信截图_20180624195526.png
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开源一个VASP批量自动投job,提取能量频率,导出结构和job管理的软件

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项目地址'https://github.com/B-C-WANG/VaspStudio'软件在这里可以找到下载地址功能-直接从MaterialStudio的xsd文件转P...
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这个软件是怎么了??

Sandon
疑难杂症特别多。如下图,project里面文件夹里的文件都没了怎么掉出来,求助
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