24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1736  |  回复: 11

寻香海棠

新虫 (初入文坛)

[求助] PCR就是不出目的条带!!!! 已有1人参与

我想做基因敲除,准备敲除的下游臂扩出来没有问题。

但是上游臂就是扩不出来。梯度PCR和降落PCR都试了,还是不行。引物设计的是60度的退火温度,软件是Omiga2.0. 引物也重新设计过了,向上增加了100bp左右,还是没有条带

用的菌株不是植物乳杆菌标准株,参考是WCFS1

诸位帮我分析一下!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

人生得意需尽欢
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

寻香海棠

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wxb2061 at 2015-09-25 23:20:19
我是质粒构建,1511的目的片段,p了三回了,都是没有p出来,温度设置50,55,58三回,就是没有目的片段

那你怎么解决呢!?

发自小木虫Android客户端
人生得意需尽欢
3楼2015-09-25 23:25:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chinaaoju

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可以先把引物沸水中煮5min,然后迅速冰浴,有利于打开引物的二级结构;
也可以在反应体系中加DMSO,BSA;
如果模板加的过多也会P 不出来;
目的基因的GC% 是不是太高?
PCR 的退火温度一般是选择引物中退火温度低的那一个再减去5 度来做为PCR 时的退火温度。
9楼2015-09-26 22:38:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

wxb2061

银虫 (小有名气)

我是质粒构建,1511的目的片段,p了三回了,都是没有p出来,温度设置50,55,58三回,就是没有目的片段

[ 发自小木虫客户端 ]
走在途中……
2楼2015-09-25 23:20:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

199006287956

木虫 (著名写手)

这个问题,我遇到过,我选择的第一个方案往往是设计温度梯度进行扩增,48-68度均试过,大部分能出来。但是还是有顽强的,如果结合引物的目的基因位置,自身不是很好和引物结合,判断结合好坏有G值决定的,不能偏低。会导致没有扩增条带,我们往往就是往外或者往里,从新设计引物。往往能批出条带。多设几个不同结合位点的引物,不差钱。

发自小木虫Android客户端
追求不惜,奋斗不息
4楼2015-09-26 00:28:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wxb2061

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 寻香海棠 at 2015-09-25 23:25:52
那你怎么解决呢!?
...

新手,继续试试
走在途中……
5楼2015-09-26 09:23:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

寻香海棠

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 199006287956 at 2015-09-26 00:28:43
这个问题,我遇到过,我选择的第一个方案往往是设计温度梯度进行扩增,48-68度均试过,大部分能出来。但是还是有顽强的,如果结合引物的目的基因位置,自身不是很好和引物结合,判断结合好坏有G值决定的,不能偏低。 ...

有木有可能参考序列,与我拿到的菌株有差异!?

发自小木虫Android客户端
人生得意需尽欢
6楼2015-09-26 11:10:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

199006287956

木虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 寻香海棠 at 2015-09-26 11:10:51
有木有可能参考序列,与我拿到的菌株有差异!?
...

这个错误一般不会犯吧!

发自小木虫Android客户端
追求不惜,奋斗不息
7楼2015-09-26 12:51:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

寻香海棠

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 199006287956 at 2015-09-26 12:51:06
这个错误一般不会犯吧!
...

我也是觉得,我下游臂都P出来了,我决定还是重新设计引物试试吧。。。你们用什么软件设计的引物?
人生得意需尽欢
8楼2015-09-26 20:04:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

199006287956

木虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 寻香海棠 at 2015-09-26 20:04:59
我也是觉得,我下游臂都P出来了,我决定还是重新设计引物试试吧。。。你们用什么软件设计的引物?...

primer5.0

发自小木虫Android客户端
追求不惜,奋斗不息
10楼2015-09-26 23:14:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 寻香海棠 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 恳请有学校收留 +5 柯淮然 2026-04-12 5/250 2026-04-15 21:49 by noqvsozv
[考研] 310求调剂 +16 666真好 2026-04-11 18/900 2026-04-15 13:28 by 黑科技矿业
[考研] 297工科调剂? +14 河南农业大学-能 2026-04-13 15/750 2026-04-15 13:25 by 黑科技矿业
[考研] 化工学硕294分,求导师收留 +32 yzyzx 2026-04-12 36/1800 2026-04-14 17:45 by lhj2009
[考研] 机械还有还有名额吗?太难了 +8 笑笑袁 2026-04-10 8/400 2026-04-14 08:44 by screening
[基金申请] 2026 WR青拔 +3 冬日阳光CAS 2026-04-09 6/300 2026-04-13 18:40 by liuchb715
[考研] 材料复试求调剂 +24 xhhdjdjsjks 2026-04-09 24/1200 2026-04-13 15:49 by 幸免 ..
[考研] 339求调剂 +4 hanwudada 2026-04-12 4/200 2026-04-13 12:03 by 蓝云思雨
[考研] 考研二轮调剂 +10 故人?? 2026-04-09 10/500 2026-04-13 09:55 by szhize
[考研] 一志愿西北工业大学289 085602 +33 yang婷 2026-04-10 34/1700 2026-04-12 08:11 by Art1977
[考研] 调剂 +10 只叙离别辞 2026-04-09 12/600 2026-04-11 20:57 by 逆水乘风
[考研] 调剂 +6 青灯不负 2026-04-09 6/300 2026-04-11 20:35 by dongdian1
[考研] 283求调剂 086004考英二数二 +17 那个噜子 2026-04-10 18/900 2026-04-11 16:27 by 明月此时有
[考研] 调剂 +5 文道星台 2026-04-11 5/250 2026-04-11 15:01 by 凯凯要变帅
[考研] 085501机械专硕 302分 不挑专业求调剂 +7 汪某. 2026-04-09 7/350 2026-04-11 14:37 by luhong1990
[考研] 0854调剂 +5 音像店听花鼓戏 2026-04-10 5/250 2026-04-11 10:49 by qingpingzhu
[考研] 283求调剂 +22 那个噜子 2026-04-09 22/1100 2026-04-11 10:41 by 逆水乘风
[考研] 一志愿985机械学硕380求调剂 +5 关关雎鸠10 2026-04-11 5/250 2026-04-11 10:10 by 知念。A
[考研] 0858求调剂 5+5 Gky09300550, 2026-04-10 8/400 2026-04-10 19:13 by chemisry
[考研] 344求调剂 +7 丶风雪夜归人丶 2026-04-09 7/350 2026-04-10 12:05 by pengliang8036
信息提示
请填处理意见