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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 载体构建菌液序列比对最后碱基不一样能用么？
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ch510246602

新虫 (初入文坛)

[交流] 载体构建菌液序列比对最后碱基不一样能用么？ 已有3人参与

构建原核载体，用的28a，序列对比发现前边都还好，后边有10多个碱基不对，不知道能否用呢？哪位大神给我指点迷津啊。
bzip29为目的片段。28a-bzip29为菌液测序结果。

载体构建菌液序列比对最后碱基不一样能用么？
捕获.PNG
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1楼 2015-07-01 18:05:04
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zhaozhibozhi

金虫 (正式写手)
★
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测序最开始的10-20个碱基是不准确的
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做一个阳光、开朗的小和尚
2楼2015-07-02 08:34:02
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sundan611

铁虫 (小有名气)
★
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1.目的片段多长啊？一般测序反应头30-50个碱基不准确也是正常的，一个测序反应理论能测800-900bp，所以看你目的片段多长了，有的时候需要正反向相测序拼接，有的时候需要分段测序，建议你正反向拼接测看看，方便的话能否把你中文版的DNAMAN软件给我传一份，谢谢！
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3楼2015-07-02 16:01:32
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ppppppppp

新虫 (小有名气)
★
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不用测了，正如楼上说的，估计那里正好是测不准的，你可以看看测序的图谱，峰很乱就是测不准。不过最后怎么会突变呢，那可是正反向引物所在序列啊。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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初来乍到，请多指教
4楼2015-07-05 08:47:41
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