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110150298

新虫 (初入文坛)

[求助] 比对序列时用点或横杠表示相同碱基是怎么做的 已有2人参与

用clustalx比对序列时,只是在最下面用*表示完全相同的碱基,很难一目了然地看出哪个地方有突变,很多文献里序列比对的图片都是以一条为基准,相同的碱基用点或横杠表示,不同的才会显示是什么碱基,大部分都交代是用clustalx比对的序列,是不是要设置,还是要用其他的软件修改?
请各位做过的帮帮忙,生物方面的软件太难用了,而且大部分是英文的,文章当中都是图片格式的,如何保存为图片格式也是个问题。
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110150298

新虫 (初入文坛)

分子方面好多都要比对序列的呀,这里面的高手应该很多的,怎么就一个机器的回复呢?
各位大侠快帮帮我呀!
2楼2013-04-11 10:25:29
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wangqi1107

银虫 (小有名气)

用DNAstar和
genedoc可以做
3楼2013-04-11 11:04:32
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110150298

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wangqi1107 at 2013-04-11 11:04:32
用DNAstar和
genedoc可以做

谢谢!
能不能说明一下怎么做的?
我用DNAstar试过,保存为记事本格式时是弄不出来那种效果的。
4楼2013-04-12 10:03:17
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WUXUEMEI01

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

先用clustalX比对(步骤:文件——打开txt或者fa格式的序列——序列——多序列比对——最后会自动生成.aln格式的文件)。
再用genedoc(步骤:文件——导入——选择clustal格式——完成。这样可以生成一个初步的多重序列比对图)
genedoc中第二排有个大写的C可以设置自己想要的类型。
没有最好,只有更好
5楼2015-05-20 14:47:37
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970321631

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

请问楼主这个问题解决了吗?如何输出用点和横线表示的图片?
6楼2016-01-26 19:53:13
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