24小时热门版块排行榜    

查看: 2497  |  回复: 5

110150298

新虫 (初入文坛)

[求助] 比对序列时用点或横杠表示相同碱基是怎么做的 已有2人参与

用clustalx比对序列时,只是在最下面用*表示完全相同的碱基,很难一目了然地看出哪个地方有突变,很多文献里序列比对的图片都是以一条为基准,相同的碱基用点或横杠表示,不同的才会显示是什么碱基,大部分都交代是用clustalx比对的序列,是不是要设置,还是要用其他的软件修改?
请各位做过的帮帮忙,生物方面的软件太难用了,而且大部分是英文的,文章当中都是图片格式的,如何保存为图片格式也是个问题。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子生化实验经验积累

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

110150298

新虫 (初入文坛)

分子方面好多都要比对序列的呀,这里面的高手应该很多的,怎么就一个机器的回复呢?
各位大侠快帮帮我呀!
2楼2013-04-11 10:25:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangqi1107

银虫 (小有名气)

用DNAstar和
genedoc可以做
3楼2013-04-11 11:04:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

110150298

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wangqi1107 at 2013-04-11 11:04:32
用DNAstar和
genedoc可以做

谢谢!
能不能说明一下怎么做的?
我用DNAstar试过,保存为记事本格式时是弄不出来那种效果的。
4楼2013-04-12 10:03:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

WUXUEMEI01

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

先用clustalX比对(步骤:文件——打开txt或者fa格式的序列——序列——多序列比对——最后会自动生成.aln格式的文件)。
再用genedoc(步骤:文件——导入——选择clustal格式——完成。这样可以生成一个初步的多重序列比对图)
genedoc中第二排有个大写的C可以设置自己想要的类型。
没有最好,只有更好
5楼2015-05-20 14:47:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

970321631

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

请问楼主这个问题解决了吗?如何输出用点和横线表示的图片?
6楼2016-01-26 19:53:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 110150298 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 333求调剂 +5 87639 2026-03-21 7/350 2026-03-21 19:31 by ColorlessPI
[考研] 0703化学调剂 +11 妮妮ninicgb 2026-03-15 15/750 2026-03-21 19:15 by ColorlessPI
[基金申请] 山东省面上项目限额评审 +3 石瑞0426 2026-03-19 3/150 2026-03-21 18:59 by RRRKKK
[考研] 材料 271求调剂 +5 展信悦_ 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:29 by 学员8dgXkO
[考研] 302求调剂 +12 呼呼呼。。。。 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:29 by ColorlessPI
[考研] 299求调剂 +6 △小透明* 2026-03-17 6/300 2026-03-21 02:42 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华中科技大学,080502,354分求调剂 +5 守候夕阳CF 2026-03-18 5/250 2026-03-21 01:06 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +7 司空. 2026-03-18 7/350 2026-03-20 23:08 by JourneyLucky
[考研] 一志愿中南化学(0703)总分337求调剂 +8 niko- 2026-03-19 9/450 2026-03-20 21:57 by luoyongfeng
[考研] A区线材料学调剂 +5 周周无极 2026-03-20 5/250 2026-03-20 21:33 by laoshidan
[考研] 0817 化学工程 299分求调剂 有科研经历 有二区文章 +22 rare12345 2026-03-18 22/1100 2026-03-20 20:39 by zhukairuo
[考研] 材料与化工专硕调剂 +7 heming3743 2026-03-16 7/350 2026-03-20 19:31 by zhukairuo
[考博] 招收博士1-2人 +3 QGZDSYS 2026-03-18 3/150 2026-03-20 11:58 by 呱呱呱呱叫
[论文投稿] 申请回稿延期一个月,编辑同意了。但系统上的时间没变,给编辑又写邮件了,没回复 10+3 wangf9518 2026-03-17 4/200 2026-03-19 23:55 by babero
[考研] 材料与化工求调剂 +7 为学666 2026-03-16 7/350 2026-03-19 14:48 by 尽舜尧1
[考研] 一志愿985,本科211,0817化学工程与技术319求调剂 +10 Liwangman 2026-03-15 10/500 2026-03-19 10:25 by 无际的草原
[考研] 344求调剂 +6 knight344 2026-03-16 7/350 2026-03-18 20:13 by walc
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
[考研] 304求调剂 +5 素年祭语 2026-03-15 5/250 2026-03-16 17:00 by 我的船我的海
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
信息提示
请填处理意见