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一申二心

铜虫 (初入文坛)

[交流] 怎样能够找出猪的基因图谱并且有碱基序列的那种 已有3人参与

我在做猪的肉质性状QTL中有效基因的筛选，但是不知道怎么找到猪的基因图谱中标出具体基因位置和有碱基序列的那种形式网站。请各位提示一下。
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1楼 2011-08-31 15:17:31
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hf0072006

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
怎么连看的人都很少哦！难道研究猪不吃香！？
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2楼2011-08-31 17:47:36
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meansq

铜虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
wanhscn(金币+5): 欢迎常来分子生物版！鼓励新虫发帖！专业！ 2011-09-14 08:35:52
在这里找：http://asia.ensembl.org/index.html
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

一申二心
迷茫
3楼2011-09-14 08:22:13
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
1楼: Originally posted by 一申二心 at 2011-08-31 15:17:31:
我在做猪的肉质性状QTL中有效基因的筛选，但是不知道怎么找到猪的基因图谱中标出具体基因位置和有碱基序列的那种形式网站。请各位提示一下。

猪的全基因组序列都快出了吧？有很多种猪的EST文库以及SNP库，可到NCBI上或者楼上的那个网站！可以先搜索猪的遗传图谱，然后在搜索锚定在你那个QTL区间的EST或者SNP序列，看看其中有没有你所要的候选基因。
非本专业，仅供参考！
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真相是最大的奢侈品
4楼2011-09-14 08:44:23
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一申二心

铜虫 (初入文坛)
送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by meansq at 2011-09-14 08:22:13:
在这里找：http://asia.ensembl.org/index.html

谢谢！这些天也在摸索中。是将NCBI和pigQTLdb结合起来用，操作自来比较麻烦，效果不是太好。你提供的网站我研究一下，希望用得上，谢谢！
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5楼2011-09-15 11:24:29
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一申二心

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by wanhscn at 2011-09-14 08:44:23:
猪的全基因组序列都快出了吧？有很多种猪的EST文库以及SNP库，可到NCBI上或者楼上的那个网站！可以先搜索猪的遗传图谱，然后在搜索锚定在你那个QTL区间的EST或者SNP序列，看看其中有没有你所要的候选基因。
非本 ...

谢谢，在这样操作的时候，发现找到理想的基因比较难
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6楼2011-09-15 11:25:37
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
西瓜(金币+2): 斑斑很热心 2011-09-15 13:06:03
引用回帖:
6楼: Originally posted by 一申二心 at 2011-09-15 11:25:37:
谢谢，在这样操作的时候，发现找到理想的基因比较难

是否可以根据EST以及SNP调出相关序列，后在拼contig?
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真相是最大的奢侈品
7楼2011-09-15 11:37:43
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