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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 比对序列时用点或横杠表示相同碱基是怎么做的
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110150298

新虫 (初入文坛)

[求助] 比对序列时用点或横杠表示相同碱基是怎么做的 已有2人参与

用clustalx比对序列时，只是在最下面用*表示完全相同的碱基，很难一目了然地看出哪个地方有突变，很多文献里序列比对的图片都是以一条为基准，相同的碱基用点或横杠表示，不同的才会显示是什么碱基，大部分都交代是用clustalx比对的序列，是不是要设置，还是要用其他的软件修改？
请各位做过的帮帮忙，生物方面的软件太难用了，而且大部分是英文的，文章当中都是图片格式的，如何保存为图片格式也是个问题。
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1楼 2013-04-09 17:25:00
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110150298

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wangqi1107 at 2013-04-11 11:04:32
用DNAstar和
genedoc可以做

谢谢！
能不能说明一下怎么做的？
我用DNAstar试过，保存为记事本格式时是弄不出来那种效果的。
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4楼2013-04-12 10:03:17
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110150298

新虫 (初入文坛)
分子方面好多都要比对序列的呀，这里面的高手应该很多的，怎么就一个机器的回复呢？
各位大侠快帮帮我呀！
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2楼2013-04-11 10:25:29
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wangqi1107

银虫 (小有名气)
用DNAstar和
genedoc可以做
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3楼2013-04-11 11:04:32
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WUXUEMEI01

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

先用clustalX比对（步骤：文件——打开txt或者fa格式的序列——序列——多序列比对——最后会自动生成.aln格式的文件）。
再用genedoc（步骤：文件——导入——选择clustal格式——完成。这样可以生成一个初步的多重序列比对图）
genedoc中第二排有个大写的C可以设置自己想要的类型。
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没有最好，只有更好
5楼2015-05-20 14:47:37
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