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Aimee6002

银虫 (初入文坛)

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专业: 高分子合成化学

[求助] gromacs分析命令

求界面宽度和基团附近水分子数量的分析命令

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1楼 2015-05-13 15:34:23

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angjzy

木虫 (小有名气)

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1，界面宽度取决于你如何定义，例如宽度你可以选取界面两端的原子的index，用g_density 选取计算得到密度曲线，两个顶端值相减就是宽度。
2，集团附近的水分子数量可以用g_select 选取你所设定的cutoff内的水分子index，然后数数就可以得到了

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2楼2015-06-25 23:18:35

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