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Aimee6002

银虫 (初入文坛)

[求助] gromacs分析命令

求界面宽度   和  基团附近水分子数量的分析命令
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angjzy

木虫 (小有名气)

1,界面宽度取决于你如何定义,例如宽度你可以选取界面两端的原子的index,用g_density 选取计算得到密度曲线,两个顶端值相减就是宽度。
2,集团附近的水分子数量可以用g_select 选取你所设定的cutoff内的水分子index,然后数数就可以得到了
2楼2015-06-25 23:18:35
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