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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » gromacs中，一个小分子然后加水是如何操作的？
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lingogo

金虫 (小有名气)

[求助] gromacs中，一个小分子然后加水是如何操作的？ 已有3人参与

个小分子然后加水是如何操作的？已经有小分子的itp和gro文件
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1楼 2015-05-03 13:37:19
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声梦奇缘001

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
首先你的说出你使用的gromacs的版本！ 一般情况下在4.XX版本上可以使用genbox，如果是5.xX的版本的话，可以使用g_solvate命令，建议你看一下手册！或者是查看安装好的gromacs目录下面的bin文件夹！
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只做不说，明知没地位，坚信有机会
2楼2015-05-03 22:05:25
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天涯1海角

木虫 (正式写手)
可以详细点吗？
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3楼2015-05-05 08:21:51
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astrozheng

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
自己在网上找教程啊。
这种细节没人会告诉你，也没多少时间告诉你。除了网上的tutorial。
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个人签名用英文会没有空格，真是个bug.
4楼2015-05-05 19:04:25
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沐风雨林

新虫 (初入文坛)
具体请参见以下链接

http://www.bevanlab.biochem.vt.e ... tutorials/lysozyme/
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5楼2015-06-26 02:08:51
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沐风雨林

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

按照下面链接的方法做。
http://www.bevanlab.biochem.vt.e ... tutorials/lysozyme/
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6楼2015-06-26 03:41:06
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