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angelababy91

新虫 (初入文坛)

[求助] DNA提纯遇到的问题 已有1人参与

本人第一次接触分子实验,现在在做提取菌株的DNA的实验。采用了CTAB法提取菌丝的DNA,操作步骤完全按照CTAB法进行,但是提取DNA之后用loading buffer 跑电泳检测DNA的纯度,发现①电泳图DNA是两条带,这是因为DNA断裂了还是DNA中有杂质呢?
②DNA中的杂质(蛋白质或RNA)该如何去除呢?具体步骤是什么呢?
③如果将提取的DNA保存在-20度冰箱里一周之后,再使用时发现DNA不纯,现在还能加入RNA酶或蛋白酶吗?那么具体加入这两种酶的步骤是什么呢?
④DNA的OD260/280的值在1.8-2.0之间时,跑ITS-PCR后电泳发现条带不太清纯,有些有拖尾现象,有些隐约是两条带,这又是为什么呢?

我做了两个月的实验了,但是还是找不到解决DNA纯度的办法,恳请各位大师帮我解决这四个问题,感激不尽啊!!!
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kuaile5420

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
angelababy91(kx444555代发): 金币+5, 鼓励交流 2015-01-07 16:46:59
您好,可以先问一下您提取DNA的目的何在?比如做PCR,还是进行大肠杆菌转化,还是送测速?根据你的目的来确定你DNA样品的纯度要求等。根据你提供的信息,来初步回答你的问题,①电泳图DNA是两条带?提取的是全基因组吗?如果是单纯的质粒或者核DNA理论上应该只有一条带;②DNA中的杂质(蛋白质或RNA)该如何去除呢?添加蛋白酶和RNA酶就可以去除,然后做个纯化就可以收集到很纯的DNA;③如果将提取的DNA保存在-20度冰箱里一周之后,再使用时发现DNA不纯,现在还能加入RNA酶或蛋白酶吗?在存放DNA之前确定其纯度,理论上应该不会再次受到其他杂志影响的呀,还有就是如果DNA没有发生降解,应该可以使用上述的纯化方法的,但是有个问题要注意下反复冻融可能对DNA不好;④DNA的OD260/280的值在1.8-2.0之间时,跑ITS-PCR后电泳发现条带不太清纯,有些有拖尾现象,有些隐约是两条带,这又是为什么呢?这个问题的产生有很多的可能性,比如,引物放久了不好用了,产生了非特异性扩增,或者该PCR体系中的那种物质效果不好了,甚至有可能是操作过程 中出现了很低级的错误(例如加酶时没有确定是否把酶都加进去了)。最后,我有个建议,你可以将你提取的菌丝DNA跑胶,做个胶回收,切你想要的条带,这样应该可以达到你的要求。如果还满意的话,给点金币哈,嘿嘿~
坚持到底就是胜利!
2楼2015-01-05 22:31:26
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angelababy91

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by kuaile5420 at 2015-01-05 22:31:26
您好,可以先问一下您提取DNA的目的何在?比如做PCR,还是进行大肠杆菌转化,还是送测速?根据你的目的来确定你DNA样品的纯度要求等。根据你提供的信息,来初步回答你的问题,①电泳图DNA是两条带?提取的是全基因组 ...

谢谢你的答复~我提取DNA的目的是要跑PCR来检测菌株的遗传多样性,所以需要DNA纯度很高。①我是用液氮研磨菌丝提取菌丝的DNA,理论上是一根带,但是我为什么跑出来两条带呢?是因为DNA断裂还是有杂质呢?②添加蛋白酶和RNA酶提纯DNA的具体操作步骤是什么呢?添加完这两种酶再纯化,那纯化的具体步骤又是什么呢?③提取完DNA后没有检测其纯度直接放进-20度冰箱保存一周后,再拿出来使用时检测其纯度不高,这个时候再添加蛋白酶和RNA酶还能纯化DNA吗?这两种酶都要放吗?怎样检测这两种酶是否都需要加呢?④我只使用了CTAB法提取DNA没有加任何酶,因为不知道这两种酶怎么加。DNA跑胶回收的具体操作步骤又是什么呢?
3楼2015-01-06 13:02:00
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angelababy91

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by kuaile5420 at 2015-01-05 22:31:26
您好,可以先问一下您提取DNA的目的何在?比如做PCR,还是进行大肠杆菌转化,还是送测速?根据你的目的来确定你DNA样品的纯度要求等。根据你提供的信息,来初步回答你的问题,①电泳图DNA是两条带?提取的是全基因组 ...

我刚来这个论坛不久,不知道怎么给你金币,你告诉我怎样给你金币吧~
4楼2015-01-06 13:08:47
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1406257228

新虫 (初入文坛)

分析多态性测序了吗?
靠山山会倒,靠人人会跑,靠自己才没问题!
5楼2016-03-23 17:38:18
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