24小时热门版块排行榜    

查看: 1944  |  回复: 9

ybQuan

金虫 (著名写手)

[交流] 关于DNA提取的问题 已有6人参与

在提取昆虫DNA的时候,裂解液中加入一定的蛋白酶K,消化结束后加入醋酸甲沉淀杂质,然后用异丙醇沉淀DNA
我像我问的是:消化完后蛋白酶K要不要处理一下?有没有必要?
百度里有人说要95°灭火15min,蛋白酶K对DNA质量有什么影响?如果95°灭火,那做PCR的时候预变性时候不是就可以了吗?
回复此楼
哥在江湖漂,很少不挨刀,不是愿意挨,是哥很无奈!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuxia82012

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
1949stone: 不停组织或样本 提取方法有点差异 2011-06-21 18:40:36
不用苯酚氯仿抽提的吗?没提过昆虫的,但是我们提链霉菌中DNA都是需要这个得
在等待中涅槃重生
2楼2011-06-21 17:48:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

西瓜

荣誉版主 (知名作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
如果不灭活,蛋白酶K会影响后续的PCR反应(Taq酶也是蛋白),但对DNA应该没有影响。不过从保存的角度来说,东西越纯越好保存,还是去掉蛋白酶K的好。
从你说的方法来看,没有抽提的步骤,蛋白酶K可能除不尽,建议还是灭活更保险。
我们也是用蛋白酶K消化样品,用PCR仪做,最后是95度15分钟灭活,还是挺方便的。
PCR预变性一般用不了15分钟这么久吧,我们一般是5分钟甚至2分钟。
3楼2011-06-21 21:38:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gwbk

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
都是用的试剂盒。用的都连原理都不清楚了~~~~
补习一下基础知识。帮楼主顶。
4楼2011-06-21 22:34:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ybQuan

金虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by 西瓜 at 2011-06-21 21:38:00:
如果不灭活,蛋白酶K会影响后续的PCR反应(Taq酶也是蛋白),但对DNA应该没有影响。不过从保存的角度来说,东西越纯越好保存,还是去掉蛋白酶K的好。
从你说的方法来看,没有抽提的步骤,蛋白酶K可能除不尽,建议 ...

你是说在PCR反应后延伸完了,再95°灭活吗?
醋酸钾沉淀杂质后上清再加无水乙醇就可以直接沉淀DNA的,你们用什么抽提?
哥在江湖漂,很少不挨刀,不是愿意挨,是哥很无奈!
5楼2011-06-22 13:12:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

西瓜

荣誉版主 (知名作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by ybQuan at 2011-06-22 13:12:01:
你是说在PCR反应后延伸完了,再95°灭活吗?
醋酸钾沉淀杂质后上清再加无水乙醇就可以直接沉淀DNA的,你们用什么抽提?

我们是用PCR仪当水浴锅而已……95度灭活是你提取DNA的最后一步,灭活之后的DNA可以存起来也可以直接进行后续的PCR实验。

我们做的是线虫,蛋白酶K处理之后再灭活蛋白酶,就可以直接作为PCR模板了,跟你们的材料不一样,方法也不一样。

我们沉淀DNA的方法跟你的差不多,只不过没用在这里。样品量大的话,可以用苯酚氯仿抽提。不过方法是越简单越好,你可以按原方法提取之后进行PCR,如果有问题,再加一步95度15分钟灭活蛋白酶K就好了,之后再进行PCR。

不要把灭活这步当成预变性直接PCR,首先蛋白酶K没灭活之前会降解Taq酶,其次95度15分钟的条件对Taq酶的活性破坏也很大。
6楼2011-06-22 15:17:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ybQuan

金虫 (著名写手)

恩谢谢你!
哥在江湖漂,很少不挨刀,不是愿意挨,是哥很无奈!
7楼2011-06-23 10:13:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zboter

银虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
最好还是在pcr之前将蛋白酶K去除
8楼2011-06-23 15:52:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
9楼2011-06-24 09:19:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

林魂逸之

铜虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
不需要的,酶的量很少,要酚:氯仿抽提可以去除。
10楼2011-10-17 20:33:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ybQuan 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 基金不中,共勉 +10 eulota 2026-08-26 10/500 2026-08-27 17:23 by lqllinqiaoli
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 面上合作单位盖章 +3 ssyjh 2026-08-27 3/150 2026-08-27 09:59 by 阿拉贡aragon
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 LIbGuocjEEYw 2026-08-26 4/200 2026-08-27 04:33 by Ie9AyIAvGbvs
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
请填处理意见