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ybQuan

金虫 (著名写手)

[交流] 关于DNA提取的问题 已有6人参与

在提取昆虫DNA的时候,裂解液中加入一定的蛋白酶K,消化结束后加入醋酸甲沉淀杂质,然后用异丙醇沉淀DNA
我像我问的是:消化完后蛋白酶K要不要处理一下?有没有必要?
百度里有人说要95°灭火15min,蛋白酶K对DNA质量有什么影响?如果95°灭火,那做PCR的时候预变性时候不是就可以了吗?
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哥在江湖漂,很少不挨刀,不是愿意挨,是哥很无奈!
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yuxia82012

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
1949stone: 不停组织或样本 提取方法有点差异 2011-06-21 18:40:36
不用苯酚氯仿抽提的吗?没提过昆虫的,但是我们提链霉菌中DNA都是需要这个得
在等待中涅槃重生
2楼2011-06-21 17:48:39
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
如果不灭活,蛋白酶K会影响后续的PCR反应(Taq酶也是蛋白),但对DNA应该没有影响。不过从保存的角度来说,东西越纯越好保存,还是去掉蛋白酶K的好。
从你说的方法来看,没有抽提的步骤,蛋白酶K可能除不尽,建议还是灭活更保险。
我们也是用蛋白酶K消化样品,用PCR仪做,最后是95度15分钟灭活,还是挺方便的。
PCR预变性一般用不了15分钟这么久吧,我们一般是5分钟甚至2分钟。
3楼2011-06-21 21:38:00
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gwbk

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
都是用的试剂盒。用的都连原理都不清楚了~~~~
补习一下基础知识。帮楼主顶。
4楼2011-06-21 22:34:58
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ybQuan

金虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by 西瓜 at 2011-06-21 21:38:00:
如果不灭活,蛋白酶K会影响后续的PCR反应(Taq酶也是蛋白),但对DNA应该没有影响。不过从保存的角度来说,东西越纯越好保存,还是去掉蛋白酶K的好。
从你说的方法来看,没有抽提的步骤,蛋白酶K可能除不尽,建议 ...

你是说在PCR反应后延伸完了,再95°灭活吗?
醋酸钾沉淀杂质后上清再加无水乙醇就可以直接沉淀DNA的,你们用什么抽提?
哥在江湖漂,很少不挨刀,不是愿意挨,是哥很无奈!
5楼2011-06-22 13:12:01
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by ybQuan at 2011-06-22 13:12:01:
你是说在PCR反应后延伸完了,再95°灭活吗?
醋酸钾沉淀杂质后上清再加无水乙醇就可以直接沉淀DNA的,你们用什么抽提?

我们是用PCR仪当水浴锅而已……95度灭活是你提取DNA的最后一步,灭活之后的DNA可以存起来也可以直接进行后续的PCR实验。

我们做的是线虫,蛋白酶K处理之后再灭活蛋白酶,就可以直接作为PCR模板了,跟你们的材料不一样,方法也不一样。

我们沉淀DNA的方法跟你的差不多,只不过没用在这里。样品量大的话,可以用苯酚氯仿抽提。不过方法是越简单越好,你可以按原方法提取之后进行PCR,如果有问题,再加一步95度15分钟灭活蛋白酶K就好了,之后再进行PCR。

不要把灭活这步当成预变性直接PCR,首先蛋白酶K没灭活之前会降解Taq酶,其次95度15分钟的条件对Taq酶的活性破坏也很大。
6楼2011-06-22 15:17:12
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ybQuan

金虫 (著名写手)

恩谢谢你!
哥在江湖漂,很少不挨刀,不是愿意挨,是哥很无奈!
7楼2011-06-23 10:13:02
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zboter

银虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
最好还是在pcr之前将蛋白酶K去除
8楼2011-06-23 15:52:17
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9楼2011-06-24 09:19:58
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林魂逸之

铜虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
不需要的,酶的量很少,要酚:氯仿抽提可以去除。
10楼2011-10-17 20:33:38
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