| 查看: 1737 | 回复: 1 | ||
[求助]
想做基因表达，扩增该基因全长cds，现引物设计上遇困难，求助各位虫友 已有1人参与
|
|
这是该基因全长mRNA序列 gene 1..1628 CDS 1..1473 ORIGIN ：(((((((((( 1 atgcaggaag cgccggccgc gctgcccacg gagccgggcc ccagcccagt gcctgccttc 61 ctcggcaagt tatgggcgct ggtgggcgac ccgggcaccg accacctgat ccgctggagc 121 ccgagcggca ccagcttcct cgtgagcgac cagagccgct tcgccaagga ggtgctgccc 181 caatacttca agcacagcaa catggcaagc ttcgtgcggc aactcaatat gtacggtttt 241 cggaaggtgg tgagcatcga gcagggtggc ctgctgagac ccgaacggga tcacgtcgag 301 ttccagcacc cgagcttcgt acgcggccga gagcaactgc tggaacgcgt gcgccgcaag 361 gtgcccgcgc tgcgcggcga cgacggccgc tggcgccccg aggacctggg ccggctgctg 421 ggcgaggtgc aggcttttcg gggagtgcaa gagagcaccg aggcgcggct gcgggaactc 481 aggcagcaga acgagatcct gtggagggag gtggtcacgc tgcggcagag ccacggtcaa 541 cagcatcggg tcatcggcaa gctgatccag tgcctctttg ggccacttca ggctgggtct 601 ggcagcgcag gagctaagag gaagctgtcg ctgatgctgg atgaggggtg cccaacgcca 661 gccaaattca acgcctgccc cttacctggt gccctcctgc aggaccccta ctttatccag 721 tcgcccctcc cggagaccac gctgggcctc agcagccctc acagggccag gggccccatc 781 atctccgacc tcccggaaga ctctccttcc cctgaaggaa ccaggctttc cccctccagt 841 ggtggcagga gggagaaggg cctggcactg ctcaaagaag agccagccag cccagggggg 901 gaaggcgagg ccgggctggc cctggcccca aacgagtgtg acttctgcgt gacagcaccc 961 ccaccgctgc ctgtggctgt ggtgcaggcc atcctggagg ggaaggggag cttcagccct 1021 gaggggccca ggaatgccca acagcctgaa ccaagaggcc ccagggaggt tcctgacagg 1081 ggccctctgg acctggagaa gggaggccgg agcccagaca gtctgctgcc tccaatgctg 1141 cttcgggccc cccctgaaag tgtggagcct gcagggccac tggatgtgct gggccccagc 1201 ctccaagggc gggaatggac tctgatggac ttagacatgg agctgtccct gttgcagccc 1261 ttggttccag agaagggtga gactgagctg gcagttaagg ggttaaattc tccaggccca 1321 ggaaaggact ccacactcgg ggcaccactc ctgctggaca tcccagcgtc tttaggaggc 1381 ccagcgctca gcctgcctgg agctttaccc atttacagca gtcctgagag ccgggcctcc 1441 tacgtgggcg cgggaggcaa cccctccccc tga ))))))) gacaccc tccgctccga gccagccctg 1501 ctgaggggct ggccggcagt agcacgcccc gctcggcttc cttgagcccc ctggtggact 1561 ctgagtgaag ccccagttac ttggcagccc ctctccattc ccgagtcctg cataaaaccg 1621 catttttt 括号里的是cds序列，现在用cdna扩增这个基因序列，cds全长要包括进来，设计引物小虫本来就不熟， 起始密码子又是第一个 ，故求助各位虫友帮着设计设计，最好也能教会我，予人鱼不如予人渔嘛！ 先行谢过！其他不会的虫友也好学习！友善的小木虫论坛！    |
回复此楼» 猜你喜欢
留学--博士招生
已经有16人回复
-
化学工程，本211，求调剂，ab区不限
已经有4人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有265人回复
-
湖北师范大学招调剂啦
已经有8人回复
-
邵阳学院食品与化学工程学院硕士调剂
已经有0人回复
-
天津商业大学 生物与医药课题组招生
已经有0人回复
-
生物化工学硕招收调剂
已经有0人回复
-
广东石油化工学院2026年硕士研究生需要多名生物，制药工程，食品专业的调剂生
已经有0人回复
-
317分 一志愿江南大学 化学工程学硕 求调剂
已经有6人回复
-
化工申博
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 有cds序列和全基因组序列,如何设计引物来克隆和表达!
已经有17人回复
- 求助检测基因沉默的qPCR引物设计问题
已经有7人回复
- 对产电菌进行荧光PCR定量，让生工设计引物，他们说要针对具体基因
已经有5人回复
- 求助转录组测序完成后，后续荧光定量、基因克隆引物设计问题
已经有8人回复
- 用基因组DNA进行PCR怎么设计引物啊
已经有10人回复
- 已经得到目的基因的全长，现在要PCR将目的基因全长P出来，如何设计引物？谢谢
已经有12人回复
- 克隆某一功能基因的全长，要不要做Race？
已经有7人回复
- 已知cds序列如何设计引物克隆全长
已经有4人回复
- 求助全序列基因扩增引物怎么设计啊
已经有5人回复
- 引物设计 基因全长的获得
已经有13人回复
- 只知道基因CDS区序列，如何扩增该基因的启动子
已经有11人回复
- 扩增基因CDS区域如何设计引物？
已经有36人回复
- 测序结果分析，以及RACE引物设计。求助呢
已经有3人回复
- 如何根据CDS序列设计引物
已经有3人回复
- 求助-基因克隆及引物设计的问题
已经有6人回复
- 要P一段基因全长，已知CDS，怎么设计引物啊？
已经有10人回复
- 载体构建技术请教，如何设计引物提取基因插入载体中？
已经有3人回复
- 已经带his标签目的蛋白基因如何设计引物啊（目的基因已经接在pET-22b的载体上了）
已经有8人回复
- 如何设计引物，扩增目的基因的ORF？
已经有6人回复
- 【求助/交流】基因做表达实验必须要克隆全长吗？
已经有7人回复
- 【求助/交流】加急~~~求助：关于基因克隆与表达引物设计的问题！希望高人指点！
已经有3人回复
- 【求助/交流】求助：关于做过量表达的基因的引物设计！
已经有4人回复
- 【求助/交流】低GC含量的模板设计引物
已经有7人回复
- 克隆基因全长引物设计问题
已经有32人回复
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
yhmpk(西门吹雪170代发): 金币+4, 鼓励热心回帖交流 2014-12-10 20:06:36
yhmpk: 金币+5, ★有帮助 2014-12-10 20:07:42
感谢参与，应助指数 +1
yhmpk(西门吹雪170代发): 金币+4, 鼓励热心回帖交流 2014-12-10 20:06:36
yhmpk: 金币+5, ★有帮助 2014-12-10 20:07:42
|
首先，我看了你的序列，估计跟我的一样，很难扩。不过呢，不试不知道，搞不好就出来了。下面就按步骤给你说说怎么设计引物。 （1）把序列放到NCBI进行BLAST； (2)找到有100%相同的序列，可以是标签，也可以是mRNA； （3）找到后下载序列，把你的基因找出来，在左右两端设计引物； （4）看是否需要，设计的时候可以加酶切位点； 你的片段有GC含量有点高，特别是在前面一段，所以估计不好扩，要用特殊的酶去扩，你可以设计一个nested-PCR去试试。 具体怎么设计什么的应该没问题吧。 |
2楼2014-12-10 15:38:01
