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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » RACE 问题 求助大家
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yoyo单眼皮

铁虫 (小有名气)

[求助] RACE 问题 求助大家 已有3人参与

本人做RACE 用的是 Clontech的 SmartRACE试剂盒  3’RACE获得900bp大小的产物，NCBI比对也是我想要的基因序列 ，但是 3‘RACE并没有到头！！比对还差400bp的长度，自然测序结果里面没有接头引物UPM 和ploy A(ploy T),求助这到底是为什么！！！？？？
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1楼 2014-09-19 10:18:11
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yoyo单眼皮

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by liukun261 at 2014-09-19 22:11:26
楼主好，
    序列中找不到UPM的话可以错配几个碱基看看，应该是可以找到的。
   
    如果你的3’端不到头的话你就将你3‘RACE的引物设计的靠近cDNA的3’端一点，这样的话就比较容易扩出来。

谢谢 我也是这么想的。嘿嘿
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5楼2014-10-06 10:25:20
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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
2楼: Originally posted by yoyo单眼皮 at 2014-09-19 15:10:33
大家帮帮忙

可能刚好遇到重复序列了，虽然是假阳性，但你运气好

[ 发自小木虫客户端 ]
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3楼2014-09-19 22:02:53
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liukun261

禁虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-09-19 23:41:48
yoyo单眼皮: 金币+2, ★有帮助 2014-10-06 10:25:04
本帖内容被屏蔽
4楼2014-09-19 22:11:26
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yoyo单眼皮

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by Neo2000 at 2014-09-19 22:02:53
可能刚好遇到重复序列了，虽然是假阳性，但你运气好
...

他们也说是我运气好。但是，重复序列是怎么个意思？
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6楼2014-10-06 10:27:48
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