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【求助/交流】5'RACE试剂盒的选择? 已有9人参与
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我打算做5‘RACE。查了一些资料,现在用得比较多的是clontech的smart技术试剂盒或者invitrogen的mRNA5’端加接头技术。 据我分析,clontech的smart技术试剂盒的优点是实验流程简单,避免对RNA样品的反复操作,缺点是RNA末端的特异性完全依赖锚定引物,如果有截短的mRNA分子,会出现常呈现不清晰的成片条带或截短的产物背景,即特异性不高,估计会对后期的结果判断和鉴定工作造成麻烦。而invitrogen的mRNA5’端加接头技术的优点是CIP首先筛除了不完整的mRNA分子,TAP脱帽,加接头后扩增如能得到阳性结果,则特异性相对较高,同时,缺点是操作复杂,要对RNA分子反复纯化三次之多,这过程中也难保不出问题。 所以我在这两种试剂盒的选择问题上犹豫不定,因为没有经验,不知道该选择哪种。我想问用过clontech的前辈,是否真的弥散带或者多条带是最常见的结果?最后阳性克隆测序时候,要测多少克隆才能得到想要的结果?而用过invitrogen的前辈,过程是不是像我想的那么复杂,都有些什么问题出现呢? 请大家给点建议! |
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