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yoyo单眼皮

铁虫 (小有名气)

[求助] RACE 问题 求助大家 已有3人参与

本人做RACE 用的是 Clontech的 SmartRACE试剂盒  3’RACE获得900bp大小的产物,NCBI比对也是我想要的基因序列 ,但是 3‘RACE并没有到头!!比对还差400bp的长度,自然测序结果里面没有接头引物UPM 和ploy A(ploy T),求助这到底是为什么!!!???
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yoyo单眼皮

铁虫 (小有名气)

大家帮帮忙
2楼2014-09-19 15:10:33
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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
2楼: Originally posted by yoyo单眼皮 at 2014-09-19 15:10:33
大家帮帮忙

可能刚好遇到重复序列了,虽然是假阳性,但你运气好

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-09-19 22:02:53
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liukun261

禁虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-09-19 23:41:48
yoyo单眼皮: 金币+2, 有帮助 2014-10-06 10:25:04
本帖内容被屏蔽

4楼2014-09-19 22:11:26
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yoyo单眼皮

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by liukun261 at 2014-09-19 22:11:26
楼主好,
    序列中找不到UPM的话可以错配几个碱基看看,应该是可以找到的。
   
    如果你的3’端不到头的话你就将你3‘RACE的引物设计的靠近cDNA的3’端一点,这样的话就比较容易扩出来。

谢谢 我也是这么想的。嘿嘿
5楼2014-10-06 10:25:20
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yoyo单眼皮

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Neo2000 at 2014-09-19 22:02:53
可能刚好遇到重复序列了,虽然是假阳性,但你运气好
...

他们也说是我运气好。但是,重复序列是怎么个意思?
6楼2014-10-06 10:27:48
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804371539

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

请问楼主怎么确定3‘产物大小
7楼2016-04-01 22:36:33
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