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foodwl

银虫 (初入文坛)

[交流] 关于定量PCR做基因表达量的疑问 已有2人参与

作为刚开始接触分子生物学的小白来说,实在是有太多的不懂,所用言语存在的不适当之处,还请大家多多批评指正。

表示一直对定量PCR的原理都看的不是太明白,不知道该怎么定一个相同的初始量来比较最终实时定量PCR的结果。
实验想要的是样品在不同贮藏时间中,某些基因得到表达量的变化。请教他人得来的最初方法是在提取总RNA之后,稀释全部样品的RNA浓度到统一的值,然后做反转录之后再将得到的所有样品的cDNA的浓度调整到一致,然后做半定量PCR之后得到合适的引物,就可以做定量PCR了

今天又听说,在半定量PCR的时候还要调整全部样品cDNA的量,使得所有样品在P内参基因后电泳的条带亮度一致,然后再用这个的量来进行定量PCR,这样再调整的话,岂不是之前的量就不一致了么???

因为本是小白,是在是越来越晕,是有步骤重复了,还是怎样,到底该如何保证定量PCR之前样品量的一致性问题呢?

实时定量的时候还是每个样品都要做一个内参么?

求各位大侠相助,不胜感激
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vapordw

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
表示新手持续关注。、。。
3楼2014-08-18 09:53:26
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owl2010

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-08-17 20:33:07
半定量是这样操作的,反转录相同的RNA用量(如1ugRNA),用actin引物去扩增每个样本,虽然反转录用的是相同的RNA量,但是actin扩增出来的片段还是会有亮度差异的问题,这时就得根据不同的亮度调整每个模板的用量,待actin扩增的片段亮度调成大体一致后,每个模板的用量也会不尽相同,然后用基因的引物在每个模板里扩增,每个模板的用量和调好actin的模板用量一致,这样就会得到基因的表达量的差异。

定量PCR可以不调模板浓度,因为每个模板都要做内参,通过计算每个模板的内参来计算每个模板基因的表达量。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

男人的组成要素:金钱、面子、性、怕死、自恋、吹牛逼。
2楼2014-08-17 18:55:42
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foodwl

银虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by owl2010 at 2014-08-17 18:55:42
半定量是这样操作的,反转录相同的RNA用量(如1ugRNA),用actin引物去扩增每个样本,虽然反转录用的是相同的RNA量,但是actin扩增出来的片段还是会有亮度差异的问题,这时就得根据不同的亮度调整每个模板的用量,待 ...

谢谢你~我大概懂了

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2014-09-09 10:53:12
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