24小时热门版块排行榜    

查看: 2352  |  回复: 8

zbblpp

新虫 (初入文坛)

[求助] 蛋白原核表达和包涵体纯化问题 已有2人参与

大家好,最近在原核表达两个蛋白,一个是153AA,一个是166AA,均有信号肽,用salI和NotI酶切位点克隆进PET28A载体中,30度诱导4h, 153AA的大表有表达,大概是20KD,表达量小,估计3%,166AA的大表没有表达。

用含溶菌酶的裂解液裂解(没有超声裂解)后,发现二者主要都是包涵体表达,因为上清中很少蛋白,用8M尿素变性(变性时由于用的是1.5ml离心管做的小样,没有超声处理,所以也是溶解一部分),之后取变性的样品上清和沉淀SDS-PAGE电泳,发现二者分子量一样是14KD,很奇怪的现象,难道是提前终止了么?还是因为变性不充分,蛋白没有完全展开,但是也不至于分子量是一样,并且偏小这么多吧?大家遇到过这样的问题么?谢谢!

对于这个现象,把诱导前的菌做了PCR鉴定,相互之间是没有污染的,并且166AA的克隆是送测序过的,所以克隆构建也没有问题。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

蛋白表达纯化与检测

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zbblpp

新虫 (初入文坛)

没人帮忙,自己顶一下
2楼2014-08-05 10:07:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
youlinglyw: 金币+3, 赠人玫瑰手有余香,生物科学有你更精彩! 2014-08-06 09:06:10
zbblpp: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢 2014-08-06 15:40:06
给你个包涵体纯化、变性和复性的实验流程吧,具体你的问题改日再讨论,今天我没有时间了。

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : Purificationofinclusionbodiesandrefoldingofproteins.pdf
  • 2014-08-05 10:38:08, 93.73 K
3楼2014-08-05 10:31:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nlbtr

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
youlinglyw: 金币+2, 赠人玫瑰手有余香,生物科学有你更精彩! 2014-08-06 09:06:18
拒绝包涵体,你可以选择真核蛋白表达
4楼2014-08-05 16:18:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zbblpp

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by nlbtr at 2014-08-05 16:18:52
拒绝包涵体,你可以选择真核蛋白表达

谢谢您,我先原核表达,看没有活性的话就继续真核表达。现在的情况看,只能继续真核了。
5楼2014-08-06 15:41:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zbblpp

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 凌波丽 at 2014-08-05 10:31:03
给你个包涵体纯化、变性和复性的实验流程吧,具体你的问题改日再讨论,今天我没有时间了。

谢谢您!
有虫友认为可能是跑胶的样品加了β-巯基乙醇,还原剂把二硫键打开了。我这两天做了验证,发现不是这个原因。153AA的有3个CYS, 其中前两个形成二硫键时有活性,但第三个也容易和前两个错配,可能就引发没有活性。我现在想如果错配的话,分子量也不至于偏小这么多吧。

不知道信号肽会不会把蛋白折断,但是折断后也应该有15.5KD的。

您的流程很有帮助,再次感谢
6楼2014-08-06 15:45:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nlbtr

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by zbblpp at 2014-08-06 15:41:09
谢谢您,我先原核表达,看没有活性的话就继续真核表达。现在的情况看,只能继续真核了。...

你表达的蛋白在量上有要求吗,因为蛋白表达量不多,纯化也是个问题
7楼2014-08-07 08:39:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

salanero2000

新虫 (初入文坛)

PAGE少表观和预期分子量不符是常有的事情,不过2个不同AA数的条带大小一样倒是有的问题。
有可能还是给个2个样品一起电泳的对比图吧。
顺便问一句,你后面打算怎么证明这个蛋白是你要的蛋白?(假设分子量和预期相符)
8楼2014-08-07 09:57:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zbblpp

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by salanero2000 at 2014-08-07 09:57:11
PAGE少表观和预期分子量不符是常有的事情,不过2个不同AA数的条带大小一样倒是有的问题。
有可能还是给个2个样品一起电泳的对比图吧。
顺便问一句,你后面打算怎么证明这个蛋白是你要的蛋白?(假设分子量和预期相 ...

谢谢您!后续验证想根据功能,是否有活性。目前看情况,感觉有活性的几率比较小。
下面是我整理了一张图片处理,这次的尿素溶解溶解的不好,但是也可以看到分子量,我在后续的实验中分子量均如此。不过今天我处理图片时,发现从这张图片看,蛋白2(166AA)的包涵体分子量好像略大那么一点点,但也在14附近,应该也有可能像您说的PAGE表观与预期分子量不符是常有的事情。

蛋白1(153AA)预测分子量是17,加上载体上的序列,20KD差不多。
蛋白1(133AA,不含信号肽),预测是15.5KD,加上载体序列差不多18.
蛋白2(166AA),预测是19.3KD,加上载体上的序列差不多应该22.这个与包涵体相差较大。

另外,最近看文献,发现有文献提到蛋白2在重组表达时可能会出现C端氨基酸丢失的现象。
蛋白原核表达和包涵体纯化问题
细菌裂解后尿素变性跑胶---.jpg

9楼2014-08-07 10:52:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zbblpp 的主题更新
信息提示
请填处理意见