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shiliyusly

新虫 (小有名气)

[求助] 反向表达载体构建已有1人参与

大家好,我现在初学载体构建方面知识。有2个问题查了很多资料都弄不明白。
1 PUCM-T载体插入PCR产物,由于PCR产物3‘端加A,PUCM-T载体是3’端加T,那岂不是只有正向基因的A才能和载体的T配对,反向的插入是连接不上的?
2 构建好的PBI121表达载体进行酶切鉴定时,是直接将质粒酶切就跑电泳鉴定呢?还是酶切后PCR再电泳?一个模板上2个上游引物为什么PCR没产物呢?
不好意思,感觉很低级的问题。。。
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DAX1

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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shiliyusly: 金币+2 2014-05-23 16:39:33
gyesang: 金币+3, 鼓励回帖交流! 2014-05-23 17:10:55
1 PUCM-T载体插入PCR产物,由于PCR产物3‘端加A,PUCM-T载体是3’端加T,那岂不是只有正向基因的A才能和载体的T配对,反向的插入是连接不上的?
是的,反向连不上。不过你要注意一般只有TAQ酶才会在产物上带a。一般的高保真酶的产物是不带a的,你需要自己加a。如果你想克隆反向产物,你就得找其他酶切位点,或者重写找个载体平端克隆。
2 构建好的PBI121表达载体进行酶切鉴定时,是直接将质粒酶切就跑电泳鉴定呢?还是酶切后PCR再电泳?一个模板上2个上游引物为什么PCR没产物呢?
你得先提取质粒,然后酶切直接电泳。你也可以先pcr鉴定是否有片段插入,然后再提质粒酶切电泳。
2楼2014-05-23 16:08:16
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DAX1

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by DAX1 at 2014-05-23 16:08:16
1 PUCM-T载体插入PCR产物,由于PCR产物3‘端加A,PUCM-T载体是3’端加T,那岂不是只有正向基因的A才能和载体的T配对,反向的插入是连接不上的?
是的,反向连不上。不过你要注意一般只有TAQ酶才会在产物上带a。一般 ...

忘了回复你的另一个问题,两个上游引物他怎么可能有产物呢,楼主你需要看看pcr的基本原理什么。
3楼2014-05-23 16:10:37
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shiliyusly

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by DAX1 at 2014-05-23 16:10:37
忘了回复你的另一个问题,两个上游引物他怎么可能有产物呢,楼主你需要看看pcr的基本原理什么。...

嘿嘿,一直以解链的下游单链为模板P啊?是量不够?
4楼2014-05-23 16:38:06
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shiliyusly

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by DAX1 at 2014-05-23 16:08:16
1 PUCM-T载体插入PCR产物,由于PCR产物3‘端加A,PUCM-T载体是3’端加T,那岂不是只有正向基因的A才能和载体的T配对,反向的插入是连接不上的?
是的,反向连不上。不过你要注意一般只有TAQ酶才会在产物上带a。一般 ...

谢谢你!那一般反义载体构建是怎么做呢?我看好几个硕士论文都是用PUCM-T载体呢,就是过程不详细,我想不通
5楼2014-05-23 16:39:26
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DAX1

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by shiliyusly at 2014-05-23 16:38:06
嘿嘿,一直以解链的下游单链为模板P啊?是量不够?...

如果引物都在上游的话,那理论上你的引物都是从左向右扩增啊,那怎么可以得到你想要的产物呢,你得有个引物从右往左扩增啊,这样你才能得到你想要得片段
6楼2014-05-23 16:51:10
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DAX1

新虫 (小有名气)

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-05-23 17:11:05
引用回帖:
5楼: Originally posted by shiliyusly at 2014-05-23 16:39:26
谢谢你!那一般反义载体构建是怎么做呢?我看好几个硕士论文都是用PUCM-T载体呢,就是过程不详细,我想不通...

1,你可以在引物两边设计两个不同粘端酶切位点(针对你得载体得),位置和你载体得刚好相反,比如你得a位点在上游引物,然后a位点在你得载体得右边。我想你得载体应该有很多多克隆位点吧。
2,就是看看你的载体是否有平端位点,找个高保真酶pcr,产物就不会带a,这样理论上你插入得片段一半机会会是反向得
7楼2014-05-23 16:56:06
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