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windleakey

金虫 (小有名气)

[求助] 重组质粒构建 连接转化效率低 求帮助啊 已有1人参与

我实验是这样的:

目的基因已经连进了T载体,下面往表达载体(pet28a、pGEX-6p-1)里面连;

首先T载体、表达载体分别双酶切:
dna 15ul、俩酶各 1ul、buffer 5ul 补水至50,切俩小时。各切两管,回收胶(天根的试剂盒)。

图是胶回收完,跑电泳看看回收效果和浓度。分别是目的片段和俩载体;

连接体系:
载体2、目的片段4、Takara的Solution1 6,12ul体系。载体和目的片段比例也尝试过好几种,效果都一样;

转化的感受态是买的,应该不会有什么问题。

最近转化完总是空板,做了4、5次了,有点找不到原因了。希望大神们给点意见。应该是连接这部分有问题。

还有几个小问题:
回收胶洗脱时为什么不用EB呢,天根回收胶试剂盒的EB是不是TB缓冲液啊?
连接不好是不是片段浓度还是有点低呢,比marker亮应该大于20ng/ul了,还需要加大酶切体系多回收些吗?
有人说takara的solution1 效率不好,是吗?

重组质粒构建 连接转化效率低 求帮助啊
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windleakey

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by pc012351 at 2014-04-03 15:12:22
切胶回收洗脱用EB没问题的,每次都这么做的,后面照样做酶切做连接,TAKARA的solution1很好用啊,从没出过问题,确认一下酶切完全了没,感受态有没有问题,别人用过没

酶切从电泳效果来看,切的还是很彻底的。感受态是买的,转质粒什么的都很正常。
实验只有一涉及连接时,才出问题,总是空板,连个假阳性都没有。
如果不是酶的问题,真的找不到原因了。
买了promega的T4,先试试吧。。。
6楼2014-04-03 21:18:51
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cm8002

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+4, 鼓励回帖交流! 2014-04-02 21:19:11
1、建议做双酶切的时候降低DNA的量,连接不需要太多,只要确保完全切开;
2、做连接,咱还是别那么省,solution1那是T载体试剂盒里的,做其他连接效率不能保证,建议用takara的T4 DNA连接酶或是其他公司的专用连接酶;
3、“回收胶洗脱时为什么不用Elution Buffer?”可以用,Elution Buffer一般就是tris-hcl 缓冲液,不过要是用于连接的话,还是建议用蒸馏水溶,因为buffer里的盐可能会影响后续的连接步骤。

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2楼2014-04-02 21:14:58
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windleakey

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by cm8002 at 2014-04-02 21:14:58
1、建议做双酶切的时候降低DNA的量,连接不需要太多,只要确保完全切开;
2、做连接,咱还是别那么省,solution1那是T载体试剂盒里的,做其他连接效率不能保证,建议用takara的T4 DNA连接酶或是其他公司的专用连接 ...

谢谢回复,学到很多。
请问,你指的是双酶切体系中减少dna的量哈,那回收片段时dna的量是不是越多越好呢?也就是说连接反应跟连接片段浓度关系大不大?
3楼2014-04-02 21:31:38
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cm8002

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by windleakey at 2014-04-02 21:31:38
谢谢回复,学到很多。
请问,你指的是双酶切体系中减少dna的量哈,那回收片段时dna的量是不是越多越好呢?也就是说连接反应跟连接片段浓度关系大不大?...

回收片段时dna的量应该是越多越好,多才有的用嘛,但是不是说有多少用多少,是吧,片段浓度对连接反应的影响还是比较大的,所以一般在回收完后都要定量每微升含多少载体和片段,不能单按照含量,得结合片段和载体的大小然后大概估算mol数,再按照3-10:1(大概是这个范围)的比例建立连接体系
4楼2014-04-03 14:08:05
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