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963979587

银虫 (初入文坛)

[求助] RNA纯度是否会影响RT-PCR的结果 已有4人参与

各位虫友们,大家好,我提取的RNA,OD260/OD230都小于1可以用来做RT-PCR吗?影响大不大?
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朱多龙

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
963979587(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-03-15 10:43:31
很难说浓度多高就能反转成功,当然浓度越高可能效果越好。我的经验是只要有明显的RNA条带,我就可以反转,效果还不错。要是条带很弥散还是不要反转了。
2楼2014-03-14 21:56:26
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bailihu01

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

3楼2014-03-15 01:20:09
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-03-15 10:43:47
尽量把质量提高些,若反转还好些,做定量那就不好用了。
hehe
4楼2014-03-15 08:14:50
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963979587

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 朱多龙 at 2014-03-14 21:56:26
很难说浓度多高就能反转成功,当然浓度越高可能效果越好。我的经验是只要有明显的RNA条带,我就可以反转,效果还不错。要是条带很弥散还是不要反转了。

不做电泳可以吗?
5楼2014-03-16 21:33:31
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963979587

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by bailihu01 at 2014-03-15 01:20:09
会不会芬类物质浓度过高!!可能影响反转录结果

有可能,有时候洗了两遍,还是有的结果小于1
6楼2014-03-16 21:34:15
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963979587

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lvbobo823 at 2014-03-15 08:14:50
尽量把质量提高些,若反转还好些,做定量那就不好用了。

唉,我就是要做荧光定量,不知道影响会不会很大?
7楼2014-03-16 21:35:00
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若溪

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
个人经验,260/230偏小的话,那就是提取的时候有机试剂有残留,提取时可以改进以下几点:
1.加氯仿抽提后取少一点上清,不要贪多。
2.加乙醇洗的时候,多晃几次,尽量让RNA沉淀整片悬浮起来(有时候确实浮不起来也没办法。)
3.弃乙醇的时候,用枪吸而不是倾倒,倒的话经常有液滴留在管壁上,倒不干净。第一次用蓝枪头吸,可以不完全吸干,免得吸到沉淀;然后短暂离心把残余酒精甩到管底,看准了用白枪头尽量吸干净。RNA量大,被白枪头弄掉一点也没关系。
4.溶解前晾干的时间可以长一点,5分钟也没关系的。标准的做法说是不能晾太久,等沉淀开始变透明就要加水溶解,但是我晾过10分钟的,后面RNA量也很大。可能量大,虽然有些溶解不了,最后浓度还是高。
没有比脚更长的路,没有比人更高的山
8楼2014-03-17 09:12:37
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963979587

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 若溪 at 2014-03-17 09:12:37
个人经验,260/230偏小的话,那就是提取的时候有机试剂有残留,提取时可以改进以下几点:
1.加氯仿抽提后取少一点上清,不要贪多。
2.加乙醇洗的时候,多晃几次,尽量让RNA沉淀整片悬浮起来(有时候确实浮不起来也 ...

谢谢哈,挺有用的
9楼2014-03-23 20:51:31
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匿名

用户注销 (正式写手)

Thomas_HT

本帖仅楼主可见
10楼2014-08-20 14:49:33
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