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echo1234

金虫 (小有名气)

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[求助] DGGE序列建系统发育树原序列和比对序列分离已有5人参与

请问一下我用DGGE测序序列用MEGA建立系统发育树的时候，在NCBI上比对的序列和原序列是完全分离的，变成了两个大的分支，即NCBI上的序列一起，原序列一起，比对的相似率基本在93%以上，不知道为什么会出现这个原因，以前做克隆文库的时候从来没有出现过这种情况。谢谢！

[ Last edited by silicare on 2014-2-17 at 11:58 ]

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1楼 2014-02-13 06:37:39

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elbo

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【答案】应助回帖

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gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-02-19 17:30:40
echo1234: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 谢谢 2014-02-25 23:02:01

你要确定NCBI下载下来的序列方向与你测序得到序列的方向一致，都是5-3端方向或者3-5方向。

8楼2014-02-19 16:29:45

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